En 1901, el edificio se convirtió en una imprenta y, tras el final de la Guerra Civil, en 1939 acogió la sede administrativa del diario Patria, ubicado allí hasta el año 1983.

A raíz del proyecto de creación del Centro y su instalación en este edificio, en el año 2000 se encargó su rehabilitación a Antonio Jiménez Torrecillas, arquitecto que contó con la colaboración del artista Gustavo Torner.

Para ello, el Centro destina varias salas a la colección personal del autor, compuesta por cuarenta cuadros y una veintena de dibujos seleccionados por el propio Guerrero, así como un archivo de documentos sobre la vida del artista.

Sin embargo, la mayor parte de la superficie del inmueble está destinada a albergar exposiciones temporales, siempre relacionadas con la creación artística contemporánea.

Además, el Centro organiza otras actividades, como charlas, conferencias y conciertos; en este último caso, destaca el Ciclo de Música Contemporánea Centro José Guerrero, que lleva celebrándose ininterrumpidamente desde el año 2004.