Abordó diversos estilos musicales, entre ellos el bolero, tango italiano, mambo, chachachá y rock and roll.

Su productor musical y por entonces director artístico del sello Odeón, Rubén Nouzeilles, consideró a Cecilia como única entre los músicos de su generación.

Con ellos llegó en 1962 a los estudios Odeón para grabar su primer trabajo solista, un disco single que, al sumar sus dos caras, combinaba dos estilos musicales distintos: un tango italiano («Uno de tantos») y un rock and roll interpretado en idioma nativo («I wanna live»).

Además, su nombre encabezó varias de las principales giras musicales organizadas por Chile en esos años.

Gran influencia tuvo en su estilo musical y artístico su primer productor musical y por entonces director artístico del sello Odeón, Rubén Nouzeilles, quien no comulgaba con el presunto facilismo de la Nueva Ola.

Tras editar un primer y único LP para CBS/Philips, Gracias a la vida (1970), intentó sin suerte iniciar una carrera en México y, a la vuelta, en pleno gobierno de la Unidad Popular, fundó su propio sello discográfico, Chía Producciones, para el que grabó algunos pocos temas de corte melancólico y romántico que tuvieron escasa difusión.

[6]​ A ello contribuyó la biografía no autorizada Cecilia, la vida en llamas (2002, Planeta), de Cristóbal Peña.

Tras permanecer un mes a la venta, el libro fue incautado por orden del Primer Juzgado del Crimen de Santiago, debido a una causa penal que buscaba evaluar posibles injurias con publicidad acusadas por la propia autora en una querella.

[9]​ Cecilia negó reiteradamente que fuese lesbiana: en una entrevista realizada por Pablo Aguilera para la revista Onda en mayo de 1973 señaló que “no me gustan las mujeres” y “Cuando me gusten las mujeres, te voy a avisar”.

[13]​[14]​[15]​ Cecilia Pantoja fue una figura clave en la música popular chilena, no solo por su talento y versatilidad, sino también por su influencia en las generaciones posteriores de artistas.

Artistas como Mon Laferte[16]​ y Denisse Malebrán se han declarado influenciados por Cecilia.

Otros de los artistas que han reconocido su legado son Javiera Parra, Ana Tijoux, Francisca Valenzuela, Gepe y Camila Moreno.

[20]​[21]​ Es un homenaje a Cecilia Pantoja, una artista que marcó la cultura popular chilena con su voz, su estilo y su bravura.