El videojuego, creado solamente por una persona, se transformó en un éxito en Japón lo suficientemente grande para que fuera traducido al inglés por el grupo Aeon Genesis.

En el año 2006 la empresa Variant Interactive anunció oficialmente que estaban en negociaciones con Pixel (el creador del juego) para lanzar una versión comercial de Cave Story en PlayStation Portable.

[3]​ Por el momento Variant Interactive no ha vuelto a pronunciarse acerca de este asunto y su foro aún permanece "en mantenimiento", con lo que la versión comercial se ha ganado el título de vaporware.

En el año 2008 la compañía Nicalis confirmó que están trabajando en una versión comercial de Cave Story 100% oficial para WiiWare, en el cual contiene gráficos y canciones mejorados y nuevos modos extra.

[4]​ También se confirmó el lanzamiento para DSiWare a finales de 2010 en Norteamérica y en 2011 en Japón.

Viene con novedades tales como un modo de juego con 2 jugadores y nuevos soundtracks.