Cuando en Bohemia empezó a reinar la dinastía de los Habsburgos en 1526, el Patio Real se quedó olvidado hasta el año 1631, cuando el lugar fue comprado por el cardenal Arnošt Harrach, quien fundó allí un seminario obispal.

[1]​ En 1689 tuvo lugar un gran incendio, después del cual quedaron solo los restos de todo el complejo.

[1]​ Del Palacio Real hasta hoy en día se conserva solo el nombre de la calle vecina Královodvorská (calle del Patio Real) y el paso a la vecina Torre de la Pólvora.

El 28 de octubre de 1918 se proclamó aquí la Primera República checoslovaca y luego en el año 1989 fue La Casa Municipal, donde tuvo lugar el encuentro del gobierno comunista con los representantes del Foro Cívico liderado por Václav Havel.

[1]​ En su decoración participaron los escultores y pintores checos más famosos de principios del siglo XX, como por ejemplo Max Švabinský, Fratišek Ženíšek, Ladislav Šaloun, Karel Novák, Josef Mařatka, Josef Václav Myslbek, Alfons Mucha, Jan Preisler y Mikoláš Aleš.