En las elecciones de 1946 obtuvo una banca en la Cámara de Senadores, para la que resultó reelecto cuatro años después, permaneciendo en la Cámara Alta hasta 1955.

Ese año asumió la dirección del periódico La Mañana, fundado por su padre, y se alejó transitoriamente de los cargos públicos.

En 1980 se manifestó contrario a la reforma constitucional propuesta por la dictadura militar ese año, y que fue rechazada en plebiscito.

En 1985, al asumir como Presidente de la República, Julio María Sanguinetti lo nombró Ministro del Interior.

Manini Ríos fue un destacado ensayista, escribiendo varios libros sobre la historia del Uruguay, en particular sobre las primeras décadas del siglo XX, como Anoche me llamó Batlle, Crónica política del Uruguay contemporáneo, etc.