Inició su carrera en 1976 defendiendo al Bolívar donde formó parte del plantel que ganó la liga boliviana en 1976 y en 1978.

En 1981 se mudó a Brasil para jugar por Palmeiras y permaneció en el club hasta 1984, jugando 113 partidos antes de marcharse.

Carlos Aragonés se mudó al Coritiba en 1984, jugando seis partidos más de la Serie A brasileña sin marcar un gol.

Jugó 31 partidos con Bolivia entre 1977 y 1981, anotando 15 goles, incluidos dos contra Brasil en la Copa América 1979.

A nivel de clubes ha dirigido a los clubes bolivianos Real Santa Cruz, The Strongest, Blooming, Oriente Petrolero, Bolívar y Jorge Wilstermann.