Marrón ingresó a la Escuela Naval Militar en 1956, una vez terminados sus estudios secundarios.
Pasó a prestar servicios en unidades más importantes a medida que fue avanzando en el escalafón militar ya que fue destinado a los cruceros ARA La Argentina y ARA General Belgrano, luego sería comandante del cazaminas ARA Formosa y posteriormente de la escuadrilla de antiminado.
[6][7] La Armada tuvo dos grandes logros en el nivel internacional durante la gestión del almirante Carlos Marrón.
[1] Como respuesta, en julio de 1999, el almirante Marrón recibió al primer lord del almirantazgo británico, Michael Boyce, y en noviembre, el propio Carlos Marrón se convirtió en el primer titular de la Armada en visitar oficialmente el Reino Unido luego del conflicto bélico por los archipiélagos del atlántico sur.
Luego de ser recomendado por Esteban Caselli, el marino recientemente retirado renunció abruptamente al no aceptar los recortes presupuestarios que tendría esa área.