Un año más tarde se convirtió en jefe del departamento en el Instituto Max-Planck de Física en Alemania.
Su primera serie de conferencias pronunciadas durante el curso 1959-1960 se publicó como un libro, The Relevance of Science.
Weizsäcker se convirtió en miembro de la Deutsche Gesellschaft für Friedens-und Konfliktforschung y comenzó la fundación del Instituto Max-Planck en Starnberg, Alemania, para la investigación sobre las condiciones de vida en un mundo científico-técnico.
Fue nombrado miembro de la orden Pour le mérite for science and arts en 1961.
Fórmula semiempírica de la masa concebida por Weizsäcker y cuyo nombre recibe, que sirve para evaluar la masa y otras propiedades de un núcleo atómico, parcialmente basada en mediciones empíricas.