El primero de la temporada, denominado Apertura 2000 el ganador, que finalizó invicto, fue Villa San Carlos.

Ambos equipos clasificaron con ventaja deportiva a las semifinales del cuadrangular para definir al campeón de la temporada.

Luego de vencer a Central Ballester y Fénix, clasificados al cuadrangular por su ubicación en la tabla de posiciones general, ambos campeones disputaron la final en la cual resultó victorioso Acassuso, que se proclamó campeón y obtuvo el único ascenso que entregó a la Primera C esta edición del campeonato.

Si el ganador del Torneo Apertura y el Clausura fuera el mismo equipo, sería el campeón.

Al final de la temporada, el equipo con el peor promedio fue suspendido en su afiliación por un año.