La primera edición[1][2] se corrió en 1946 en la ciudad de Cali y fue ganada por el ciclista bogotano Jaime Gómez.La versión femenina de este campeonato se corrió por primera vez en 1987 en la ciudad de Cúcuta y fue ganadora fue la ciclista antioqueña Adriana Muriel,[4] quien a su vez cuenta con el mayor número de ediciones ganadas con cinco en total.Este campeonato se realizó en la ciudad de Cali incluyendo competencias de pista y ruta y se usó para seleccionar al equipo nacional que representó posteriormente a Colombia en los Juegos del Caribe realizados en Barranquilla en diciembre[7] de ese año.Desde su inicio y hasta 1967 la competencia solo tenía un único campeón para la prueba de fondo de ruta y en 1968 se incluyó una carrera para ciclistas juveniles[8] coronando así un Campeón Nacional de Ruta categoría “Mayores” y otro “Juvenil”.Con la profesionalización del ciclismo colombiano, desde 1986 hasta 1995 las categorías cambiarían con el fin de tener pruebas diferenciadas para profesionales[9] y aficionados coronándose así un Campeón Nacional de Ruta categoría “Profesional”[10] y otros de categoría “Aficionado” (Mayores y Juvenil).
