Para el campeonato de 1999 los derechos de transmisión por televisión fueron otorgados a los canales privados Caracol Televisión y RCN Televisión (alternando entre ellos la transmisión de un partido por fecha) y también a la cableoperadora Sky (hasta 3 partidos por fecha).
El ganador del torneo Apertura clasificaba directamente a la Copa Libertadores del año 2000 así mismo ganaba el derecho a disputar la final por el título de la liga.
Cabe destacar que en el Torneo Finalización se definió al ganador por medio del sistema de cuadrangulares semifinales y final.
Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; Dif=Diferencia de gol Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; DIF=Diferencia de gol La segunda fase del Torneo Finalización de 1999 consiste en los cuadrangulares semifinales.
Los ganadores de cada grupo se enfrentan en la final del segundo semestre .