Luego el mismo club Cerro presentó un recurso judicial para detener el campeonato alegando la existencia de anomalías.
En la primera etapa del torneo, Sport Colombia ganó un partido a Cerro Corá, pero luego perdió los puntos en una protesta por haber utilizado un jugador no registrado, esto hizo que Cerro Corá quedara empatado con Presidente Hayes en puntos, y por lo tanto este último tuviera derecho a disputar contra el mismo un desempate por un lugar en la liguilla final.
No obstante, el club Presidente Hayes se mostró en desacuerdo y decidió no intervenir en un "desempate" o play-off y ceder el lugar a C. Corá, sin embargo, Cerro Porteño declaró que el reglamento no permite el abandono de partidos (walkovers), por lo que la participación de Cerro Corá en la liguilla sería ilegal.
Todo esto, llevó al Consejo Nacional de Deportes (instancia gubernamental) a investigar las irregularidades en la Liga (hoy A.P.F.
Pos=Posición; PJ=Partidos jugados; PG=Partidos ganados; PE=Partidos empatados; PP=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; Dif=Diferencia de goles; Pts=Puntos