El Campeón de Campeones 1989-90 fue la XXXVII edición del Campeón de Campeones que debió enfrentar al campeón de la Liga 1989-90 y al campeón de la Copa México 1989-90 .
Al ser el Puebla Fútbol Club el campeón, tanto del Campeonato de Liga como del de Copa, se le adjudicó el trofeo sin disputar el partido, siguiendo la norma existente.
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