Todo ello se consigue con una estructura formada por una plantilla experimentada en la Tercera División, así como el entrenador José Luis Rodríguez Loreto, y una dirección deportiva dirigida por Ander Garitano, ambos exjugadores zaragocistas, y con Juan Carlos Ruiz de Lazcano como director deportivo del fútbol base.Para la etapa que inicia el Ebro en Segunda B ficharía un buen número de jugadores aragoneses, exzaragocistas y otros con experiencia en la categoría.La temporada siguiente repiten presencia en esa ronda copera donde les apea el CD Leganés.En la temporada 2022-2023 tras 8 años compitiendo nacionalmente tanto en Segunda División B de España como en Segunda Federación el club acaba descendiendo tras una mala temporada en la que primero el entrenador Zaragozano Raúl Jardiel y después, el entrenador del filial, el Club Deportivo Robres Javier Genovés no pudieron evitar descender a un equipo que acabó la temporada colista de su grupoPara la temporada 2021-22 el conjunto arlequinado vuelve a su estadio, en el barrio zaragozano de La Almozara.[10] Durante la etapa en el que el Club Deportivo Ebro era un equipo de las categorías regionales aragonesas sus jugadores eran, como otros tantos, aficionados no profesionales los que pasaron por el Campo del Carmen del zaragozano barrio de La Almozara.Sin embargo, en cuanto el club tomó su nuevo rumbo y se abrió camino en el semiprofesionalismo, gozó del juego en su equipo de prometedores jugadores de la cantera zaragocista como Adán Pérez, José Carlos Gil, Edu García, Kevin Lacruz u Óscar Valero en sus últimos años en Tercera y sus primeros pasos en Segunda B.
