[4]​ Tras abandonar España se mudó a México[a]​ y pasó varios años junto a su primera esposa, Gladys Eve Green, carteándose o visitando directamente a los protagonistas de los hechos (entre ellos Jaime Balius[5]​) y recopilando y organizando material sobre la guerra, con el que constituyó uno de los más importantes archivos del mundo sobre el tema que se conserva actualmente en el Instituto Hoover de la Universidad de Stanford.

[2]​ Escribió tres libros sobre la guerra de España: The Grand Camouflage: The Communist conspiracy in the Spanish Civil War (en español, El Gran Engaño: las izquierdas y su lucha por el poder en la zona republicana), publicado en 1961; The Spanish Revolution (en español, La Revolución española), publicado en 1979, y la obra monumental de más de 1200 páginas La Guerra Civil Española: Revolución y Contrarrevolución, publicada en 1989 por Alianza Editorial (y reeditada en 2015).

Julio Aróstegui señaló al político socialista Juan Negrín como «el gran villano de la obra bollotiana».

[10]​ La obra de Bolloten ha tenido gran influencia en otros hispanistas norteamericanos como Stanley G. Payne y en la historiografía sobre la guerra en la propia España.

El Gran Engaño: Las izquierdas y su lucha por el poder en la zona republicana (en inglés The Grand Camouflage: The Communist Conspiracy in the Spanish Civil War) trata, al igual que Homenaje a Cataluña de George Orwell, de los conflictos internos del bando republicano y, en particular, de la acción del Partido Comunista de España en ese aspecto que, según el autor, perjudicó gravemente al bando republicano.