En esta época fue encabezado por François Arago y Henri Poincaré.
La Agencia hoy en día funciona como una academia y todavía se reúne mensualmente para tratar asuntos relacionados con la astronomía.
Más tarde trabajó para sincronizar el tiempo a través del imperio colonial francés, determinando el lapso necesario para el viaje de ida y vuelta de una señal hasta las distintas colonias francesas.
La Agencia Francesa de Longitudes estableció una comisión en el año 1897 para extender el sistema métrico a la medición del tiempo.
El resto de países del mundo no dio ningún soporte a las propuestas de la Comisión, y el gobierno francés no estaba preparado para asumir esta propuesta en solitario.