A diferencia de los copépodos, además del único ojo fusionado, poseen dos ojos simples a cada lado de la cabeza.

El cuerpo de los branquiuros es traslúcido, hasta el punto de que únicamente se aprecia la zona abdominal en donde se encuentra el aparato digestivo.

Los parásitos suelen fijarse sobre las branquias de un pez, a veces en cantidades tan grandes que pueden producir la muerte del animal.

Las mandíbulas están reducidas, presentan bordes cortantes y están alojadas dentro de un aparato en forma de estilete llamado probóscide, en tanto que los apéndices se reducen, aun cuando no llegan a desaparecer del todo.

Según Martin & Davis (2001),[3]​ los branquiuros se clasifican de la siguiente manera: Subclase Branchiura Thorell, 1864