Joya estudió en el Instituto San Francisco de Tegucigalpa.

Posteriormente se enlistó como soldado raso y dentro de dos años se convirtió en el primer sargento más joven del ejército, con 19 años de edad.

[6]​[7]​ También fue el fundador y primer comandante del escuadrón Cobra, donde estuvo activo durante la década de los 70.

La misma fue rechazada por considerarse inexistente una persecución política, con las garantías suficientes en Honduras para un proceso justo ante unas acusaciones fundadas por violaciones a los derechos humanos contra el Sr.

[10]​ En total, Joya ha sido acusado de 27 crímenes, incluyendo detenciones ilegales y tortura.

[12]​ También en 2012 publicó su libro Así me acusaron, donde se defiende y narra su versión de los hechos.

[1]​[n 3]​ Argumenta que dicho escuadrón fue creado en 1984, dos años después de sus presuntos crímenes, y que se especializaba en intervención de armas, no contrainsurgencia.