En la actualidad la entidad cuenta con seis equipos filiales donde forma tanto futbolística como educacionalmente a los posibles futuros jugadores de la primera plantilla.
[3] Para los jugadores que poseen edades entre los 15 y 18 años y que viven demasiado lejos del campo de entrenamiento, el club tiene para ellos un edificio residencial,[6] pudiendo vivir hasta 14 jóvenes.
También se encarga de otros pequeños problemas que pudieran tener los jugadores jóvenes.
[9] SpVgg Unterhaching, Ingolstadt 04, Kickers Offenbach y Ulm 1846 son denominados socios élites.
[12] Las instalaciones de entrenamiento para los profesionales y los juveniles se hallan en München-Giesing.
Además hay un café, una biblioteca y una sala de aprendizaje electrónico.
Al ser parte, los jugadores promesa de la cantera pueden mejorar y avanzar como futbolistas.
Algunos de los que pasaron por la academia son Owen Hargreaves, Michael Rensing, Bastian Schweinsteiger, Philipp Lahm, Holger Badstuber y Thomas Müller.
[14] El FC Bayern Campus es un complejo deportivo ubicado en la ciudad de Múnich que actualmente se encuentra en obras.
[16] El centro cuenta con aproximadamente 30 hectáreas, vendidas por el estado al club alemán en 2006, y está ubicado en la antigua sede de los cuarteles Fürst-Wrede en el Ingolstädter Straße en el norte de Múnich, 2,5 km al suroeste del Allianz Arena en el distrito Freimann.
[17] En el piso superior existe una estancia común, que cuenta con cocina y sala de juegos.
[17] De esta residencia han salido jugadores como Holger Badstuber, Bastian Schweinsteiger, Owen Hargreaves, Piotr Trochowski o Sammy Kuffour, siendo David Alaba el último jugador que ha logrado dar el salto al primer equipo desde la residencia de la cantera tras firmar su primer contrato profesional en la temporada 2010-2011.