O'Doherty sublevó a las fuerzas locales y posiblemente esperaba negociar un acuerdo con el gobierno, como había sido común con los líderes de las rebeliones anteriores.

[1]​ Sin embargo, el lord teniente en Dublín, Arthur Chichester, respondió rápidamente y envió refuerzos al área bajo el mando de Richard Wingfield.

Eran una mezcla de soldados profesionales del Ejército Real Irlandés y guerreros celtas aliados al gobierno.

Se encontraron con los rebeldes en Kilmacrennan y O'Doherty fue asesinado por un disparo de mosquete en la cabeza.

[2]​ Con la muerte de O'Doherty, la rebelión rápidamente colapsó, y las fuerzas finales se retiraron a la isla Tory, donde fueron sitiadas con éxito.