[2] Fue nombrado para sustituir a Fernando Primo de Rivera, que había terminado una exitosa campaña militar contra los independentistas con el Pacto de Biak-na-Bató.Sin embargo, el optimismo del gobierno español, que esperaba reconducir la situación al poco tiempo, ordenó a Primo de Rivera su regreso a la península, lo que dejaba a Basilio Augustín con toda la responsabilidad.Agravado el problema con los estadounidenses y reiniciada la rebelión de los tagalos, el general pronto comenzó a tomar posturas equivocadas.Durante el ataque de la armada norteamericana a la española en el Cavite, ante la amenaza norteamericana de bombardear Manila ordenó que las baterías cesaran de apoyar a la armada española lo que tuvo consecuencias desastrosas.Su siguiente plan fue organizar una milicia filipina dirigida por nativos leales, pero tras armar varios regimientos estos desertaron y se pusieron al lado de Aguinaldo.
