Su nombre da origen al de la isla donde está situada, entre los ríos Guadiana (frontera con Portugal) y Carreras (con Isla Cristina).
Con la toma de Sevilla el 31 de enero de 1810 por los franceses, la Academia Militar de Sevilla se convirtió en batallón, con Mariano Gil de Bernabé al frente del mismo, dirigiéndose hacia Niebla para llegar hasta Isla Canela, Ayamonte con la orden de poner a buen resguardo los caudales públicos que gestionaba la Junta Central Suprema en ese momento.
En Ayamonte fue disuelta la Academia oficialmente el 11 de febrero.
Hoy en día y aun con el auge de turismo en la zona, el barrio logra mantener el ambiente marinero y familiar que lo caracteriza.
La principal fuente de ingresos es la pesca y venta de productos del mar, así como sus preciados mariscos.