Originalmente fue creado como el Servicio Nacional de Crédito Agrícola (SNCA), adoptando su nombre y forma definitivas en 1962.
Desde comienzos del siglo XX hubo diversos intentos de crear una entidad estatal de crédito para el ámbito rural.
Francisco Cambó, durante su etapa como ministro de Fomento (en 1918), intentó sin éxito la creación de un Instituto Nacional Agrario.
[5] El SNCA en sus primeros años no llegó a disponer de fondos suficientes para la demanda existente.
[7][8] Desapareció en 1991, tras su integración junto a otros bancos públicos en la corporación Argentaria.