El blindaje ha sido mejorado en comparación con su predecesor, proporcionándole protección contra proyectiles de 14,5 mm en el arco frontal.

A la izquierda del lanzador 9Sh119M1 se encuentra el lanzagranadas automático AGS-17 de 30 mm.

Un número limitado de estos vehículos se han producido y están en servicio en Rusia para sus tropas internas.

El BTR-90 tiene su parte frontal extrema en forma de punta, algo similar a la del LAV-25.

Posee un motor turbo, refrigerado por líquido, multi-combustible diésel, que puede desarrollar una potencia de 510 CV.

Opcionalmente, un sistema BPK-M de imágenes térmicas se puede instalar en este compartimiento como la vista del artillero.

Estas están diseñados para permitir el desmontaje rápido y embarque de las tropas, incluso mientras el vehículo está en movimiento.

Su transmisión mecánica hidráulica ayuda a aumentar su maniobrabilidad proporcionando velocidades diferentes para cada lado del vehículo.

Algunas placas adicionales blindadas se puede instalar en el vehículo para aumentar la protección.

Los métodos activos de protección también pueden ser utilizados, tal como blindaje reactivo explosivo.

Un sistema de misil guiado también está disponible para atacar objetivos blindados.

La unidad de lanzamiento es desmontable y puede ser utilizado para lanzar proyectiles desde el suelo.

Las armas del vehículo le permiten atacar objetivos a distancias de hasta 4 km.

Otra variante del BTR-90 está equipada con un cañón antitanque de 125 mm, pero con la ametralladora 2S25.