En 1839 obtuvo su doctorado en medicina, y dos años más tarde comenzó a trabajar como asistente del psiquiatra Jean-Pierre Falret (1794–1870) en el Hospital de la Pitié-Salpêtrière en París.
En el asilo Maréville estudió a los minusválidos mentales, realizando investigaciones sobre sus historias familiares con hincapié en aspectos tales como la pobreza o enfermedades físicas de la infancia.
En 1856 comenzó a desempeñarse como director del asilo mental de Saint-Yon en Ruan.
En 1857 publicó Traité des dégénérescences physiques, intellectuelles et morales de l'espèce humaine et des causes qui produisent ces variétés maladives, en el cual explica la naturaleza, causas e indicaciones de la degeneración humana.
Morel concibió el término démence precoce (en latín, dementia praecox) en 1860 para describir un desorden mental que ataca inicialmente a los seres humanos en la adolescencia o juventud adulta, y finalmente lleva al deterioro de las funciones mentales y a la discapacidad.