Kennedy fue mortalmente herido por disparos mientras circulaba en el coche presidencial en la plaza Dealey.
Tres investigaciones oficiales concluyeron que Lee Harvey Oswald, un empleado del almacén fue el asesino.
A las 12:30 entra en la Plaza Dealey y avanza por la calle Houston, en ese momento lleva seis minutos de retraso.
3,5 segundos después se produce el segundo disparo que llega a Kennedy por detrás en su espalda y sale por su garganta, Kennedy se lleva ambas manos a su garganta levantando sus codos mientras su esposa lo observa atónita.
Cuando ocurre el tercer disparo, este impacta en forma visible y de lleno en el hueso parietal derecho de la cabeza de Kennedy, Jackie Kennedy suelta súbitamente a su esposo quien se recuesta hacia el lado izquierdo, mientras esta se abalanza a horcajadas a la parte trasera del auto.
La esposa del gobernador se tira al suelo y suelta unas flores.
quien iba en el mismo coche, sentado adelante del presidente, también fue gravemente herido, pero sobrevivió.
James Tague, un espectador y testigo del asesinato, también recibió una pequeña herida en la parte derecha de su cara, estaba situado a 82 metros frente al sitio donde Kennedy fue alcanzado.
Fue inútil, porque aunque le hubieran devuelto las constantes tenía medio cerebro fuera del cráneo y ya no existía actividad neuronal, como comprobaría el neurocirujano Kemper Clark.
La autopsia fue realizada por tres médicos de la Armada con treinta oficiales militares como testigos.
El informe del FBI sobre la autopsia fue realizado por los agentes especiales Sibert y O'Neill.
También, durante su Funeral, fue interpretado "El Duelo de la Patria", obra del costarricense Rafael Chávez Torres.
El FBI concluyó que Lee Harvey Oswald hizo los tres disparos.
Sin embargo mucha evidencia se ha acumulado en torno a la posibilidad de una conspiración.
House of Representatives Select Committee on Assassinations) o (HSCA) fue creado en 1976 para investigar los asesinatos de John F. Kennedy y del Dr. Martin Luther King Jr..
Las investigaciones del comité duraron hasta 1978 y en 1979 emitieron el informe final.
El Departamento de Justicia, FBI, CIA, y la Comisión Warren fueron severamente criticados por su pobre desempeño en las investigaciones llevadas a cabo y el Servicio Secreto fue tildado de deficiente en su protección al Presidente.
UU elegidos en intervalos de 20 años, particularmente aquellos que ganaron elecciones celebradas en años terminados en cero, solían tener como trágica coincidencia el que fallecían en el desempeño del cargo.
La serie de casos se inició en 1841 con William Henry Harrison (elegido en 1840) y continuó con Abraham Lincoln (1860) en 1865, Garfield (1880) en 1881, McKinley (1900) en 1901, Harding (1920) en 1923, Roosevelt (1940) en 1945, con lo que el asesinato de John F. Kennedy (1960) no hizo más que continuar este patrón, siendo su deceso el séptimo consecutivo.