En 1940 fue nombrado comandante de la Flota del Norte, cargo que conservó durante toda la Segunda Guerra Mundial.Tuvo una larga y destacada carrera en la Armada Soviética que se extendió desde 1925 hasta los primeros años de la Guerra Fría.[4] Aunque posteriormente fue reforzada con un destructor líder,[nota 1] el Bakú, dos destructores más pequeños de la clase Gnevnyː el Razyaryonny y el Razumny y cinco submarinos, procedentes de la Flota del Pacífico.[6] La tarea de proteger a los expuestos convoyes aliados, recaía tanto en la Royal Navy como en la Flota soviética del Norte.En un clima brutalmente hostil, los submarinos causaron estragos a los buques alemanes cargados con suministros con destino a las ateridas y mal equipadas tropas alemanas desplegadas en la zona ártica.El capitán del submarino soviético respondió «Dejad que bailen en el hielo nadie les ha invitado».Además, la Flota del Norte causó daños importantes en 118 buques de transporte, militares o auxiliares.[10] Está programada para ser completada y entrar en servicio a finales de 2021 o 2022.[12] Su esposa fue la actriz rusa de cine y teatro, Kira Nikoláyevna Golovkó.[14] A lo largo de su carrera militar Arseni Golovkó recibió las siguientes condecoracionesː[16]
