Fue en el año 1939 cuando Macabich realizó la primera propuesta de clasificación, que se mantuvo hasta su muerte en 1973.
Durante los años posteriores el estado del fondo documental se deterioró, propiciando protestas al Archivo, hasta que finalmente el pleno del Ayuntamiento de Ibiza acordó la contratación de personal para ayudar a recuperar y mantener el buen estado de la documentación archivada.
Fueron Joan Marí Cardona y Joana María Ferrer Ferrer los encargados, poco después, de realizar una nueva clasificación de los fondos documentales.
Las 25 secciones en las que están clasificados los fondos documentales son las siguientes: Secciones especiales Sección del Archivo Histórico de Ibiza creada en 2002, cuya función es recopilar, inventariar y conservar el material de imagen y sonido que tenga relación con la isla; además del material existente en el Consell, fotografías, vídeos, etc., correspondientes a diferentes temáticas relacionadas con la promoción turística y cultural o con actos institucionales.
Las secciones con las que cuenta este archivo audiovisual son las siguientes: