Cassese decidió finalmente seguir una carrera académica en derecho internacional público bajo la dirección de Sperduti.

En 2002, recibió el Gran Premio otorgado por la Académie Universelle des Cultures, presidida por el Premio Nobel Elie Wiesel, por su "excepcional contribución a la protección de los derechos humanos en Europa y en el mundo".

[10]​ En 2010, la Accademia dei Lincei le concedió el Premio Feltrinelli de Ciencias Jurídicas.

[12]​ Fue el primer Presidente del Tribunal Penal Internacional para la ex Yugoslavia (TPIY), cargo que ocupó de 1993 a 1997.

[13]​ Tras su mandato como Presidente, continuó siendo juez del Tribunal hasta febrero de 2000.

[14]​ Por ello fue criticado, ya que esto contradecía la norma general de que la responsabilidad objetiva en este caso no puede formar parte del derecho penal de los países civilizados.

Esta Comisión debía investigar las posibles violaciones internacionales y de los derechos humanos que se estaban produciendo en Darfur, y determinar si se habían producido o no actos de genocidio.

[17]​ Esta conclusión era contraria a la posición de Estados Unidos, que ya había calificado las actividades del gobierno como "genocidio".