[1]​ Bartoněk estudió filología clásica en la Universidad Masaryk de Brno.

[1]​ Desde su graduación en 1952, trabajó en esta universidad, primero como asistente, desde 1962 como profesor y desde 1968 como catedrático.

La mayor parte de la investigación publicada por Bartoněk se dedicó a los estudios micénicos y a la lingüística griega.

A pesar de las evidentes dificultades, mantuvo contactos con destacados colegas occidentales.

Cabe destacar una tarjeta postal que recibió de John Chadwick: había pasado los controles fronterizos, aunque estaba escrita íntegramente en escritura lineal B. Bartoněk fue también autor, junto a su esposa Daša Bartoňková, de algunas guías de viajes,[2]​ como una guía cultural de la zona fronteriza entre Austria y la República Checa.