Preocupada por la educación de Annie y su hermano Sally decidió ir a visitar a Bruce, pero antes de que pudieran hablar, Annie tuvo que ser llevada al hospital luego de que esta se hiriera con un pedazo de alambre de púas y tuvo que ser llevada en el hospital, mientras estaban ahí Sally le preguntó a Bruce en dónde estudiaba Annie y este respondió que ambos estudiaban en casa donde "recibían" una buena educación por medio del trabajo duro y la Biblia.
Sin embargo al no haber recibido ninguna educación anteriormente se le hizo muy difícil aprender a leer y escribir, poco después Lucas Holden se convirtió en su tutor y comenzó a ayudarla, pero Geoff no estaba de acuerdo con esto ya que creía que Lucas era una mala persona y le dijo que se alejara de ella.
De regresó a la granja Geoff y Annie se sorprendieron al ver que Bruce había sellado las ventanas de sus habitaciones, furioso por haberla visto con Lucas en la playa la acusó falsamente de haber llevado pornografía a la casa, la obligó a orar para que sea perdonada y luego la encerró en su cuarto.
Durante una excursión Annie y Rory fueron al baño pero cuando regresaron se dieron cuenta de que el autobús los había dejado, sin embargo fueron encontrados por Henk Van Minnen y Cassie Turner quienes los llevaron de vuelta.
Cuando Annie decidió que quería hacer las paces con su abuelo buscó la ayuda del Reverendo John Hall, este lo visitó lo encontró en mal estado y lo llevó al hospital.
Su enamoramiento por Lucas continuó creciendo, pero cuando Annie trató de besarlo este la rechazó, devastada Annie huyó de la granja pero luego fue encontrada por Michael quien la llevó al hospital donde se reconcilió con su abuelo, quien dejó que ella y su hermano regresaran a la granja.
Poco después se alegró cuando Geoff aceptó salir con su amiga Melody, pero cuando Melody le confió que había sido atacada por Axel, Annie se lo contó a Geoff, Belle y Aden.
Poco después Annie casi muere cuando quedó atrapada con la tormenta subiendo pero fue rescatada por la oficial Charlie Buckton.