Se casó en primeras nupcias con Rodrigo de Mendoza, hermano de su padre para evitar pleitos sucesorios.

Sólo dos hijas del matrimonio llegarían a la madurez.

Su primogénita, Luisa de Mendoza, se casó con el segundo hijo del duque de Lerma, Francisco de Sandoval y Rojas; su hija María López de Mendoza se casó con García Álvarez de Toledo Osorio, III duque de Fernandina, después marqués de Villafranca.

[2]​ Tras quedar viuda en 1587, en 1594 contrajo matrimonio con Juan Hurtado de Mendoza, Mayordomo mayor de los Reyes Felipe III y Felipe IV y también Caballerizo mayor de este último, hijo del marqués de Mondéjar, Íñigo López de Mendoza.

El matrimonio tuvo dos hijas, María, fallecida a los 12 años, y Ana de Mendoza, que casó con Francisco Diego López de Zúñiga Guzmán Sotomayor y Mendoza, VII duque de Béjar.