Al final de la República de Weimar, Hugenberg ya contaba en el DNVP con un grupo político amplio, pero confinado en su militancia a la clase media y a las élites adineradas, y con poco apoyo entre el proletariado alemán que prefería otros líderes más radicales.

Hugenberg apoyó activamente estas maniobras políticas, aun admitiendo que el DNVP se tornara "socio minoritario", pero en premio a su auxilio fue designado después Ministro de Economía y Agricultura del nuevo régimen.

Hugenberg aceptó el puesto ministerial esperando que el radicalismo de Hitler pronto menguaría y que tarde o temprano el propio NSDAP podría ser "alineado" con las posiciones del DNVP, esperando Hugenberg convertirse progresivamente en el verdadero poder político detrás de Hitler y "moderar" al líder nazi en sus planteamientos más extremos.

Los líderes nazis como Joseph Goebbels ya mostraban desagrado de mantener a Hugenberg tan cercano al poder político, mientras otros nazis -subordinados suyos en teoría- como Fritz Reinhardt y Walther Darré forzaron diversas disposiciones gubernamentales en materia económica que Hugenberg jamás habría aceptado.

Hugenberg continuó dedicado a los negocios, pero tras su salida del gobierno alemán en 1933 resultó apartado de toda influencia política, pues aunque era diputado en el Reichstag dicha asamblea perdió toda relevancia en pocos meses.

En 1943 Hugenberg debió vender a la editorial del Partido nazi, Eher Verlag, lo que quedaba de su imperio editorial, aunque ganando a cambio participaciones en las ganancias de las industrias siderúrgicas del Ruhr, con lo cual conservó su fortuna.