En el año 1986 se graduó como ingeniero agrónomo en la Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco.

Ha trabajado para Bayer Perú SA como representante de desarrollo, y para agroveterinaria La Granja Kayra SRL como representante de ventas.

[3]​ Fue militante del Partido Nacionalista Peruano desde el año 2006 hasta el año 2021,[4]​ ejerciendo como secretario general departamental del partido entre 2005 y 2006 y secretario general provincial desde 2010.

[5]​ En las elecciones parlamentarias del año 2011, Agustín Molina postuló al Congreso de la República por el departamento del Cusco por la alianza Gana Perú.

Molina obtuvo 17,108 votos y fue juramentado como congresista de la república para el periodo parlamentario 2011-2016.