Fue nombrado Rector Magnífico de la hoy " Pontificia" Universidad Católica Madre y Maestra en el 1970, donde previamente se había desempeñado como Vicerrector (1963-1970).
Educadores y expertos en desarrollo nacionales e internacionales la catalogan como la mejor universidad dominicana y una de las mejores de Latinoamérica, garantizando a sus egresados una formación integral, humanística y de una alta calidad académica.
Dr. Alfredo de la Cruz Baldera y más adelante, se desempeñó como Presidente de la Fundación Universitaria Madre y Maestra.
[2] En septiembre de 2013, Núñez Collado reveló que el hasta entonces nuncio apostólico Józef Wesolowski había sido destituido por pederastia,[3] pero la cúpula de la iglesia dominicana lo desmintió en un comunicado.
[4] Monseñor Núñez Collado recibió varios reconocimientos nacionales e internacionales por su labor: