A ambos lados de esta protuberancia hay sendos orificios (fenestras dorsotemporales), y el hueso circundante es relativamente liso.

El hueso cuadrado, en la región temporal del cráneo, tiene una proyección rectangular (tubérculo aductor), el cual servía como zona de inserción para los músculos que cerraban la mandíbula.

Aegisuchus casi con certeza no alcanzaba las máximas longitudes, pero podría ser mucho más largo que los mayores crocodiliformes, incluyendo a Deinosuchus, Gryposuchus, Purussaurus y Sarcosuchus.

Siendo un crocodiliforme "rostro de pato", Aegisuchus puede haber tenido un hocico mucho más largo con respecto a su longitud corporal que los crocodilianos actuales.

Como en muchos crocodilianos, la región con superficie rugosa estaba probablemente cubierta con una piel gruesa firmemente adherida al cráneo.

Aunque sólo se conoce la parte posterior del cráneo, otras características pueden ser inferidas de su pariente cercano Aegyptosuchus.

La barra postorbital, un puntal óseo que suele estar orientado de forma vertical en muchos crocodilianos, se presenta en Aegisuchus casi horizontal.

Aegisuchus tenía una articulación muy flexible entre el cráneo y la columna vertebral, permitiéndole un mayor ángulo de elevación que en otros crocodilianos.

Bernissartia fagesii Susisuchus anatoceps Isisfordia duncani Hylaeochampsa vectiana Aegisuchus witmeri Aegyptosuchus peyerii Borealosuchus spp.

[1]​ El Cretácico Superior fue una época importante en la evolución de los crocodilianos debido a que muchas masas terrestres se estaban separando.