Es definido filogenéticamente como el último ancestro común de Alligator mississippiensis (el aligátor americano) y Crocodylus niloticus (el cocodrilo del Nilo) y todos sus descendientes.

[1]​ Abajo se presenta el cladograma mostrando las relaciones filogenéticas de los Brevirostres según Brochu (1997):[2]​ Gavialoidea Borealosuchus † Pristichampsus † Alligatoroidea Crocodyloidea El grupo Brevirostres fue originalmente nombrado por Karl Alfred von Zittel en 1890.

Von Zittel consideró a Gavialis, el gavial, como un pariente cercano de Tomistoma, el falso gavial, y los excluyó de este grupo.

Tomistoma, como su nombre de género distinto implica, tradicionalmente no se le ha considerado como cercanamente relacionado con Gavialis, sino que generalmente se le clasifica como un crocodílido.

Si esta clasificación es aceptada, Brevirostres podría ser considerado como un sinónimo más moderno de Crocodylia.