Después de su graduación pasó un año enseñando química y física en la Academia Militar Eagleswood en Perth Amboy, Nueva Jersey.Al año siguiente Duffield renunciaría para fundar la compañía farmacéutica Parke, Davis & Co.Lyons dio clases y manejó una farmacia hasta 1881 cuando Parke, Davis & Co.Lyons hizo muchos avances importantes en los procedimientos farmacéuticos mientras trabajó en Parke, Davis & Co.Entre sus estudiantes se encontraba Hiram Bingham III, mejor conocido por revelar al mundo la existencia de Machu Picchu.