Este equipo no tuvo grandes triunfos, pero siempre contó con el apoyo de la gente.
Fue un equipo aguerrido que se esforzó en gran medida en su estancia en la primera división.
De los 24 partidos disputados en este torneo de Liga 84-85, el Puebla obtuvo 14 victorias y 2 empates consiguiendo 30 puntos que le valieron, con 53 goles a favor y 30 en contra, el equipo campeón fue el América.
En el verano 2000 de nuevo protagoniza al alcanzar otra liguilla por obtener 32 puntos quedando en primero del grupo 1 y tercer lugar general y teniendo como goleador a Oswaldo Nartallo que contabilizo 9 goles, se enfrentó en cuartos a Atlético Yucatán perdiendo el de ida 3-1, en la vuelta los Ángeles lo masacrarón 6-0 en el estadio Cuauhtémoc; en semifinal jugó contra Irapuato empatando el primero 1-1 y en la vuelta los freseros dan cuenta, ganando 2-1. luego de concluido el torneo la directiva del Puebla no quiso solventarlos más ecónomicamente y vendieron los mejores jugadores mientras otros pasaron al primer equipo, entonces deciden "jugársela" con jugadores de cantera que promediaban 18 años, y como nuevo técnico llegó Guillermo Vázquez Mejia, el resultado fue un pésimo torneo de 10 puntos ubicándose en último lugar general; primero empatan 1-1 con Lobos UAP y solo lograron ganar 3 veces siendo ante Yucatán 2-1 en la jornada 3; 2-1 a Bachilleres en la 5 y 3-0 a Halcones de Querétaro en la 7; a partir de ese triunfo impuso una marca negativa de 12 derrotas consecutivas en la subdivisión.
terminada la temporada la directiva del equipo lo vende a la Universidad Cuauhtémoc de Puebla; quienes lo renombran San Sebastián para el torneo Verano 2001, así termina su segunda etapa.