De 1985 a 1987 el equipo fue dirigido por el entrenador Román Favela, sin más logros que una posición estable en la media tabla.

En 1988 las Águilas pasaron a ser entrenadas por Rafael Cháirez Chávez y en 1989 por Roberto Paredes, quien condujo al conjunto durante cuatro temporadas logrando obtener un campeonato en 1991 frente a las Liebres del Instituto Tecnológico de Ciudad Juárez.

[4]​ En 1993 el equipo perdió el apoyo de la Rectoría, lo que provocó que tuvieran que jugar en esa temporada bajo el nombre de Águilas Club teniendo como entrenadores a Luis Cervantes y Raúl Altamirano, no logrando clasificar en el torneo de la recién creada Conferencia Norte de Fútbol Americano Estudiantil.

En 2011 fueron subcampeones luego de perder frente a Linces UVM Guadalajara 35-28.

Running Backs (Corredores) Wide Receivers (Receptores) Tight Ends (Alas-Cerradas) Offensive Linemen (Linea Ofensiva) Defensive Linemen (Linea Defensiva) Linebackers (Apoyadores) Defensive Backs (Secundaria) Special Teams (Equipos Especiales)