El ARN ribosómico 18S (abreviado ARNr 18S ) es parte del ARN ribosómico . La S en 18S representa las unidades Svedberg . El ARNr 18S es un ARNr SSU , un componente de la subunidad pequeña ribosómica eucariótica ( 40S ). El ARNr 18S es el ARN estructural del pequeño componente de los ribosomas citoplasmáticos eucariotas y, por tanto, uno de los componentes básicos de todas las células eucariotas.
El ARNr 18S es el homólogo citosólico eucariota del ARN ribosómico 16S en procariotas y plastidios . El ARNr 18S también es un homólogo del ARN ribosómico 12S en las mitocondrias .
Los genes que codifican el ARNr 18S se denominan genes de ARNr 18S . Los datos de secuencia de estos genes se utilizan ampliamente en el análisis molecular para reconstruir la historia evolutiva de los organismos, especialmente en los vertebrados, ya que su lento ritmo evolutivo los hace adecuados para reconstruir divergencias antiguas.
El gen de ARNr 18S de la subunidad pequeña (SSU) es uno de los genes más utilizados en estudios filogenéticos y un marcador importante para la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) de destino aleatorio en la detección de biodiversidad ambiental. [1] En general, las secuencias de genes de ARNr son de fácil acceso debido a las regiones flanqueantes altamente conservadas que permiten el uso de cebadores universales . [1] Su disposición repetitiva dentro del genoma proporciona cantidades excesivas de ADN molde para la PCR, incluso en los organismos más pequeños. El gen 18S forma parte del núcleo funcional ribosómico y está expuesto a fuerzas selectivas similares en todos los seres vivos. Así, cuando se publicaron los primeros estudios filogenéticos a gran escala basados en secuencias 18S ( por ejemplo, por Field et al. , 1988), [2] el gen fue celebrado como el principal candidato para reconstruir el árbol de la vida de los metazoos . [1] Posteriormente, las secuencias de 18S proporcionaron evidencia de la división de los clados de Ecdysozoa y Lophotrochozoa (grupo monofilético de organismos compuestos por un ancestro común y todos sus descendientes lineales), contribuyendo así a un cambio revolucionario en nuestra comprensión de las relaciones de los metazoos . [1]
Sin embargo, durante la última parte de la década de 2000, y con un mayor número de taxones incluidos en las filogenias moleculares, se hicieron evidentes dos problemas. En primer lugar, existen impedimentos de secuenciación predominantes en representantes de ciertos taxones, como las clases de moluscos Solenogastres y Tryblidia , taxones de bivalvos seleccionados y la enigmática clase de crustáceos Remipedia . [1] La imposibilidad de obtener secuencias 18S de taxones individuales se considera un fenómeno común, pero rara vez se informa. [1] En segundo lugar, a diferencia de las grandes esperanzas iniciales, el 18S no puede resolver los nodos en todos los niveles taxonómicos y su eficacia varía considerablemente entre los clados. Esto se ha discutido como un efecto de la rápida radiación antigua en períodos cortos. Actualmente se cree que los análisis multigénicos brindan resultados más confiables para rastrear eventos de ramificación profunda en metazoos, pero el 18S todavía se usa ampliamente en análisis filogenéticos. [1]
Este artículo incorpora texto CC-By-2.0 de la referencia. [1]