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Proteína adaptadora de transporte vesicular

Una descripción general del tráfico de algunos complejos de proteínas adaptadoras (AP).
Complejos de Proteína Adaptadora y subcomplejo COPI-F. [1]

Las proteínas adaptadoras del transporte vesicular son proteínas involucradas en la formación de complejos que funcionan en el tráfico de moléculas de una ubicación subcelular a otra. [2] [3] [4] Estos complejos concentran las moléculas de carga correctas en vesículas que brotan o se desprenden de un orgánulo y viajan a otro lugar, donde se entrega la carga. Si bien se han resuelto algunos de los detalles de cómo estas proteínas adaptadoras logran su especificidad de tráfico, todavía queda mucho por aprender.

Hay varios trastornos humanos asociados con defectos en los componentes de estos complejos [5] [6], incluidas las enfermedades de Alzheimer y Parkinson . [7]

las proteínas

Complejos de Proteína Adaptadora, COPI y TSET.
Más vías de tráfico. Tenga en cuenta que los colores no son los mismos que en la figura principal.
Una representación de un tubo COPII.
La evolución temprana de los complejos de proteínas adaptadoras.
La evolución de TSET, COPI y AP del último ancestro común eucariota
Producción de una vesícula recubierta de clatrina.
Imagen de microscopio electrónico de una vesícula recubierta. Se pueden observar series EM que muestran la gemación de este tipo de vesículas [8] y [9]

La mayoría de las proteínas adaptadoras son heterotetrámeros . En los complejos AP, hay dos proteínas grandes ( ~ 100 kD ) y dos proteínas más pequeñas. Una de las proteínas grandes se denomina β ( beta ), con β1 en el complejo AP-1, β2 en el complejo AP-2 , etc. [10] La otra proteína grande tiene diferentes designaciones en los diferentes complejos. En AP-1 se denomina γ ( gamma ), AP-2 tiene α ( alfa ), AP-3 tiene δ ( delta ), AP-4 tiene ε ( épsilon ) y AP-5 tiene ζ ( zeta ). [10] Las dos proteínas más pequeñas son una subunidad mediana llamada μ ( mu ~50 kD) y una subunidad pequeña σ ( sigma ~20 kD), y denominadas del 1 al 5 correspondientes a los 5 complejos AP. [10] Los componentes de COPI (cop one), un coatómero , y TSET (T-set), un complejo de tráfico de membrana, tienen heterotetrámeros similares a los complejos AP. [11]

Retromer no está estrechamente relacionado, ha sido revisado [12] y sus proteínas no se describirán aquí. Las GGA (localización de Golgi, homología del dominio auditivo de gamma-adaptina, proteínas de unión a ARF) son un grupo de proteínas relacionadas (tres en humanos) que actúan como proteínas adaptadoras de clatrina monoméricas en varios tráficos importantes de vesículas de membrana , [13] pero no son similares. a cualquiera de los complejos AP y no se discutirá en detalle en este artículo. Las estoninas (que no se muestran en la figura principal) también son monómeros similares en algunos aspectos al GGA [4] y tampoco se discutirán en detalle en este artículo.

Los PTB son dominios proteicos que incluyen NUMB , DAB1 y DAB2 . Epsin y AP180 en el dominio ANTH son otras proteínas adaptadoras que se han revisado. [4]

Un importante complejo de transporte, COPII , no aparecía en la figura principal. El complejo COPII es un heterohexámero, pero no está estrechamente relacionado con los complejos AP/TSET. Las proteínas individuales del complejo COPII se denominan proteínas SEC porque están codificadas por genes identificados en mutantes secretores de levadura. Un aspecto especialmente interesante de COPII es que puede formar vesículas y túbulos esféricos típicos para transportar moléculas grandes como precursores de colágeno , que no pueden caber dentro de vesículas esféricas típicas. La estructura de la COPII se ha discutido en un artículo abierto [14] y no será el tema central de este artículo. Estos son ejemplos del conjunto mucho más grande de adaptadores de carga. [3]

Consideraciones evolutivas

El ancestro común más reciente (MRCA) de los eucariotas debe haber tenido un mecanismo para el tráfico de moléculas entre sus endomembranas y orgánulos , y se ha informado de la probable identidad del complejo adaptador involucrado. [11] Se cree que el MRCA tenía 3 proteínas involucradas en el tráfico y que formaban un heterotrímero. Ese heterotrímero luego se "dimerizó" para formar un complejo de 6 miembros. Los componentes individuales cambiaron aún más hasta convertirse en los complejos actuales, en el orden que se muestra, siendo AP1 y AP2 los últimos en divergir. [11]

Además, un componente de la TSET, una muniscina también conocida como proteína TCUP, parece haber evolucionado hasta formar parte de las proteínas de los opistocontes (animales y hongos ). [11] Partes de los complejos AP han evolucionado hasta convertirse en partes de las proteínas GGA y stonin. [4] Hay evidencia que indica que partes del complejo de poros nucleares y COPII pueden estar relacionados evolutivamente. [15]

Formación de vesículas de transporte.

Una pequeña porción de una proteína accesoria se une específicamente a parte del complejo AP-2.
La fosforilación de proteínas permite interacciones específicas con un complejo de proteína adaptadora de clatrina

El tipo de vesícula mejor caracterizado es la vesícula recubierta de clatrina (CCV). La formación de una vesícula COPII en el retículo endoplásmico y su transporte al cuerpo de Golgi . La participación del heterotetrámero de COPI es similar a la de la situación AP/clatrina, pero la cubierta de COPI no está estrechamente relacionada con las cubiertas de las vesículas CCV o COPII. [16] [17] AP-5 está asociado con 2 proteínas, SPG11 y SPG15 , que tienen cierta similitud estructural con la clatrina y pueden formar la capa alrededor del complejo AP-5, [18] pero la ultraestructura de esa capa no es conocido. Se desconoce el pelaje de AP-4. [19] [un]

Una característica casi universal del ensamblaje de la cubierta es el reclutamiento de diversos complejos adaptadores a la membrana "donante" por la proteína Arf1 . La única excepción conocida es AP-2, que es reclutado por un lípido particular de la membrana plasmática . [20]

Otra característica casi universal del ensamblaje de abrigos es que los adaptadores se reclutan primero y luego reclutan los abrigos. La excepción es COPI, en la que las 7 proteínas se reclutan en la membrana como un heptámero. [dieciséis]

Como se ilustra en la imagen adjunta, la producción de una vesícula recubierta no es instantánea, y una fracción considerable del tiempo de maduración se utiliza realizando interacciones "abortivas" o "inútiles" [21] hasta que ocurren suficientes interacciones simultáneamente para permitir que la estructura seguir desarrollándose. [22]

El último paso en la formación de una vesícula de transporte es "pellizcar" la membrana donante. Esto requiere energía, pero incluso en el caso bien estudiado de los CCV, no todos requieren dinamina . La ilustración adjunta muestra el caso de los CCV AP-2; sin embargo, los CCV AP-1 y AP-3 no usan dinamina. [23]

Selección de moléculas de carga.

Las moléculas de carga que se incorporan a un tipo particular de vesícula dependen de interacciones específicas. Algunas de estas interacciones son directamente con complejos AP y otras indirectamente con "adaptadores alternativos", como se muestra en este diagrama. [4] Como ejemplo, las proteínas de membrana pueden tener interacciones directas, mientras que las proteínas que son solubles en la luz del orgánulo donante se unen indirectamente a complejos AP uniéndose a proteínas de membrana que atraviesan la membrana y se unen en su extremo lumenal a la molécula de carga deseada. . Las moléculas que no deberían incluirse en la vesícula parecen quedar excluidas por "apiñamiento molecular". [24]

Las "señales" o "motivos" de aminoácidos en las proteínas de carga que interactúan con las proteínas adaptadoras pueden ser muy breves. Por ejemplo, un ejemplo bien conocido es el motivo dileucina , en el que un residuo de aminoácido (aa) de leucina va seguido inmediatamente por otro residuo de leucina o isoleucina . [25] [b] Un ejemplo aún más simple es la señal basada en tirosina , que es YxxØ (en un residuo de rosina separado por 2 residuos de aa de otro residuo de aa hidrofóbico voluminoso ). La figura adjunta muestra cómo una pequeña parte de una proteína puede interactuar específicamente con otra proteína, por lo que estos breves motivos de señalización no deberían sorprender. [26] El tipo de comparaciones de secuencias utilizadas, en parte, para definir estos motivos. [10]

En algunos casos, las modificaciones postraduccionales , como las fosforilaciones (que se muestran en la figura), son importantes para el reconocimiento de la carga.

Enfermedades

Se han revisado las enfermedades adaptadoras . [6]

Los AP-2/CCV ​​están implicados en la hipercolesterolemia autosómica recesiva a través de la proteína adaptadora del receptor de lipoproteínas de baja densidad asociada 1 . [27] [28]

Retromer participa en el reciclaje de componentes de la membrana plasmática. La importancia de ese reciclaje en una sinapsis se insinúa en una de las figuras de la galería. Hay al menos tres formas en las que la disfunción del retrómero puede contribuir a los trastornos cerebrales, incluidas las enfermedades de Alzheimer y Parkinson. [7]

AP-5 es el complejo descrito más recientemente, y una de las razones que respaldan la idea de que es un auténtico complejo adaptador es que está asociado con paraplejía espástica hereditaria , [18] al igual que AP-4. [6] AP-1 está relacionado con el síndrome de MEDNIK . AP-3 está relacionado con el síndrome de Hermansky-Pudlak . COPI está relacionado con una enfermedad autoinmune . [29] COPII está relacionado con la displasia cráneo-lentículo-sutural . Una de las proteínas GGA puede estar implicada en la enfermedad de Alzheimer. [30]

Galería

Ver también

Notas

  1. ^ AP-4 es mucho menos abundante que otros complejos AP y está ausente en varios organismos modelo, lo que dificulta los análisis bioquímicos y genéticos.
  2. ^ El motivo completo "basado en dileucina" es (D/E)XXXL(L/I), donde X es cualquier aa y D/E son residuos de ácido aspártico o glutámico

Referencias

  1. ^ Aquí se puede ver una vista diferente de los 5 complejos AP" Mattera R, Guardia CM, Sidhu SS, Bonifacino JS (2015). "Figura 1: Aislamiento de tepsina como interactor AP-4". J Biol Chem . 290 (  52 ) : 30736–49 : 10.1074 / jbc.M115.683409 .​ 
  2. ^ Bonifacino JS (2014). "Proteínas adaptadoras implicadas en la clasificación polarizada". La revista de biología celular . 204 (1): 7-17. doi :10.1083/jcb.201310021. PMC 3882786 . PMID  24395635. 
  3. ^ ab Paczkowski JE, Richardson BC, Fromme JC (2015). "Adaptadores de carga: estructuras iluminan los mecanismos que regulan la biogénesis de vesículas". Tendencias en biología celular . 25 (7): 408–16. doi :10.1016/j.tcb.2015.02.005. PMC 4475447 . PMID  25795254. 
  4. ^ abcde Robinson MS (2015). "Cuarenta años de vesículas recubiertas de clatrina" (PDF) . Tráfico . 16 (12): 1210–38. doi : 10.1111/tra.12335 . PMID  26403691. S2CID  13761396.
  5. ^ De Matteis MA, Luini A (septiembre de 2011). "Trastornos mendelianos del tráfico de membranas". El diario Nueva Inglaterra de medicina . 365 (10): 927–38. doi :10.1056/NEJMra0910494. PMID  21899453.
  6. ^ abc Bonifacino J (28 de enero de 2014). "Enfermedades del adaptador: biología celular y medicina puente". videocast.nih.gov . Institutos Nacionales de Salud . Consultado el 15 de abril de 2017 .
  7. ^ ab Small SA, Petsko GA (marzo de 2015). "Retromer en la enfermedad de Alzheimer, la enfermedad de Parkinson y otros trastornos neurológicos". Reseñas de la naturaleza. Neurociencia . 16 (3): 126–32. doi :10.1038/nrn3896. PMID  25669742. S2CID  5166260.
  8. ^ "aquí".
  9. ^ McMahon, Harvey T.; Galope, Jennifer L. (2005). "aquí". Naturaleza . 438 (7068): 590–596. doi : 10.1038/naturaleza04396. PMID  16319878. S2CID  4319503.
  10. ^ abcd Mattera R, Guardia CM, Sidhu SS, Bonifacino JS (2015). "Las interacciones bivalentes motivo-oído median la asociación de la proteína accesoria tepsina con el complejo adaptador AP-4". La Revista de Química Biológica . 290 (52): 30736–49. doi : 10.1074/jbc.M115.683409 . PMC 4692204 . PMID  26542808. 
  11. ^ abcd Hirst J, Schlacht A, Norcott JP, Traynor D, Bloomfield G, Antrobus R, Kay RR, Dacks JB, Robinson MS (2014). "Caracterización de la EET, un antiguo y extendido complejo de tráfico de membranas". eVida . 3 : e02866. doi : 10.7554/eLife.02866 . PMC 4031984 . PMID  24867644. 
  12. ^ Burd C, Cullen PJ (2014). "Retromer: un maestro conductor de la clasificación de endosomas". Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 6 (2): a016774. doi : 10.1101/cshperspect.a016774. PMC 3941235 . PMID  24492709. 
  13. ^ Tan J, Evin G (2012). "Tráfico de la enzima 1 que escinde APP en el sitio Β y patogénesis de la enfermedad de Alzheimer". Revista de neuroquímica . 120 (6): 869–80. doi : 10.1111/j.1471-4159.2011.07623.x . PMID  22171895. S2CID  44408418.
  14. ^ Zanetti G, Prinz S, Daum S, Meister A, Schekman R, Bacia K, Briggs JA (2013). "La estructura de la capa de vesículas de transporte COPII ensamblada sobre membranas". eVida . 2 : e00951. doi : 10.7554/eLife.00951 . PMC 3778437 . PMID  24062940. 
  15. ^ Promponas VJ, Katsani KR, Blencowe BJ, Ouzounis CA (2016). "Evidencia de secuencia de ascendencia común de coatómeros de endomembrana eucariotas". Informes científicos . 6 : 22311. Código Bib : 2016NatSR...622311P. doi :10.1038/srep22311. PMC 4773986 . PMID  26931514. 
  16. ^ ab Faini M, Beck R, Wieland FT, Briggs JA (junio de 2013). "Cubiertas de vesículas: estructura, función y principios generales de montaje". Tendencias en biología celular . 23 (6): 279–88. doi :10.1016/j.tcb.2013.01.005. PMID  23414967.
  17. ^ Jackson LP (agosto de 2014). "Estructura y mecanismo de la biogénesis de vesículas COPI". Opinión actual en biología celular . 29 : 67–73. doi :10.1016/j.ceb.2014.04.009. PMID  24840894.
  18. ^ ab Hirst J, Borner GH, Edgar J, Hein MY, Mann M, Buchholz F, Antrobus R, Robinson MS (2013). "Interacción entre AP-5 y las proteínas de paraplejía espástica hereditaria SPG11 y SPG15". Biología molecular de la célula . 24 (16): 2558–69. doi :10.1091/mbc.E13-03-0170. PMC 3744948 . PMID  23825025. 
  19. ^ Frazier MN, Davies AK, Voehler M, Kendall AK, Borner GH, Chazin WJ, Robinson MS, Jackson LP (2016). "Base molecular para la interacción entre AP4 β4 y su proteína accesoria, la tepsina". Tráfico . 17 (4): 400–15. doi :10.1111/tra.12375. PMC 4805503 . PMID  26756312. 
  20. ^ Yu X, Breitman M, Goldberg J (2012). "Un mecanismo basado en la estructura para el reclutamiento de coatómero a las membranas dependiente de Arf1". Celúla . 148 (3): 530–42. doi :10.1016/j.cell.2012.01.015. PMC 3285272 . PMID  22304919. 
  21. ^ Kirchhausen, Tom. "Construyendo burbujas". youtube.com . harvard.edu. Archivado desde el original el 21 de diciembre de 2021 . Consultado el 23 de abril de 2017 .
  22. ^ Cocucci E, Aguet F, Boulant S, Kirchhausen T (agosto de 2012). "Los primeros cinco segundos en la vida de un pozo recubierto de clatrina". Celúla . 150 (3): 495–507. doi :10.1016/j.cell.2012.05.047. PMC 3413093 . PMID  22863004. 
  23. ^ Kural C, Tacheva-Grigorova SK, Boulant S, Cocucci E, Baust T, Duarte D, Kirchhausen T (2012). "Dinámica de portadores intracelulares que contienen clatrina / AP1 y clatrina / AP3". Informes celulares . 2 (5): 1111–9. doi :10.1016/j.celrep.2012.09.025. PMC 3513667 . PMID  23103167. 
  24. ^ Hirst J, Edgar JR, Borner GH, Li S, Sahlender DA, Antrobus R, Robinson MS (2015). "Contribuciones de epsinR y gadkin al tráfico intracelular mediado por clatrina". Biología molecular de la célula . 26 (17): 3085–103. doi :10.1091/mbc.E15-04-0245. PMC 4551321 . PMID  26179914. 
  25. ^ Mattera R, Boehm M, Chaudhuri R, Prabhu Y, Bonifacino JS (2011). "Conservación y diversificación del reconocimiento de señales de dileucina mediante variantes del complejo de proteína adaptadora (AP)". La Revista de Química Biológica . 286 (3): 2022–30. doi : 10.1074/jbc.M110.197178 . PMC 3023499 . PMID  21097499. 
  26. ^ Traub LM, Bonifacino JS (2013). "Reconocimiento de carga en endocitosis mediada por clatrina". Perspectivas de Cold Spring Harbor en biología . 5 (11): a016790. doi : 10.1101/cshperspect.a016790. PMC 3809577 . PMID  24186068. 
  27. ^ Herencia mendeliana en línea en el hombre (OMIM): 605747
  28. ^ "Entrez Gene: proteína adaptadora 1 del receptor de lipoproteínas de baja densidad LDLRAP1".
  29. ^ Herencia mendeliana en línea en el hombre (OMIM): 616414
  30. ^ Herencia mendeliana en línea en el hombre (OMIM): 606006

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