El linaje B.1.617 es un linaje del SARS-CoV-2 , el virus que causa la COVID-19 . [1] Atrajo la atención internacional por primera vez a fines de marzo de 2021 después de que el recién creado INSACOG realizara la secuenciación del genoma en muestras positivas en varios estados de la India . El análisis de muestras de Maharashtra había revelado que, en comparación con diciembre de 2020, hubo un aumento en la fracción de muestras con las mutaciones E484Q y L452R . [2] Más tarde, los medios de comunicación denominaron al linaje B.1.617 como un mutante doble . [3]
El linaje B.1.617 tiene tres sublinajes según la nomenclatura PANGO :
B.1.617.1 (variante Kappa), detectada por primera vez en la India en diciembre de 2020
B.1.617.2 (variante Delta), detectada por primera vez en la India a fines de 2020
B.1.617.3, observado por primera vez en enero de 2021 [4]
Mutaciones
Proteína de “espiga” del SARS-CoV-2
A continuación se presentan algunas de las mutaciones comunes presentes en la proteína de la espícula del linaje B.1.617. No todos los sublinajes del B.1.617 comparten las mismas mutaciones:
L452R . La sustitución en la posición 452, una sustitución de leucina por arginina , confiere una mayor afinidad de la proteína de la espiga por el receptor ACE2 y una menor capacidad de reconocimiento del sistema inmunológico. [5] [6] Estas mutaciones, cuando se toman individualmente, no son exclusivas de la variante; más bien, su aparición simultánea lo es. [5] [7] Esta mutación está presente en los tres sublinajes de B.1.617.
T478K. La sustitución en la posición 478, una sustitución de treonina por lisina , [8] sólo se encuentra en el linaje B.1.617.2. [9]
E484Q . La sustitución en la posición 484, una sustitución de ácido glutámico por glutamina , confiere al linaje B.1.617 un mayor potencial de unión al receptor ACE2 humano , así como una mejor capacidad para evadir los sistemas inmunológicos de los huéspedes en comparación con otras variantes. Esta mutación no está presente en el genoma B.1.617.2. [10]
P681R . La sustitución en la posición 681, una sustitución de prolina por arginina , que, según William A. Haseltine , puede aumentar la infectividad a nivel celular de la variante "al facilitar la escisión de la proteína precursora S a la configuración activa S1/S2". [10] Esta mutación está presente en los tres sublinajes de B.1.617.
Historia
Según una fuente, la primera secuencia del genoma B.1.617 se envió a GISAID en el otoño de 2020. [12] El equipo de PANGO, que se encarga de la curación manual del árbol filogenético del SARS-CoV-2, observó que la secuencia más antigua era del 7 de diciembre de 2020. Propusieron una nueva designación para la variante que contiene las mutaciones en la proteína de pico, incluidas G142D, L452R, E484Q, D614G, P681R, entre otras, y a esta variante se le asignó el linaje B.1.617 de PANGO el 1 de abril de 2021. [13] Revisaron el árbol filogenético para incluir tres sublinajes de B.1.617 el 21 de abril de 2021 después de notar que no todas las secuencias del genoma asignadas por la herramienta PANGOLIN contenían el mismo conjunto de mutaciones. [14]
Hasta mediados de abril de 2021, la India fue la que presentó la mayor cantidad de genomas de B.1.617, seguida en frecuencia por el Reino Unido y los EE. UU. Según la información del genoma, el linaje B.1.617 se detectó por primera vez en el Reino Unido el 22 de febrero de 2021 y en los EE. UU. el 23 de febrero de 2021. [12]
Tras detectar 77 casos del linaje B.1.617 en el Reino Unido a mediados de abril de 2021, Public Health England designó al linaje como una variante en investigación. [15] En menos de dos meses, la variante Delta se convertiría en la variante dominante en el Reino Unido y los investigadores afirmaron que las primeras pruebas sugerían que podría haber un mayor riesgo de hospitalización por Delta en comparación con la variante Alpha, que era la dominante anteriormente. [16]
Referencias
^ "Linaje B.1.617". Linajes de PANGO . Consultado el 12 de junio de 2021 .
^ "La secuenciación del genoma realizada por INSACOG muestra variantes preocupantes y una nueva variante en la India". Oficina de Información de Prensa del Gobierno de la India . 24 de marzo de 2021.
^ "Covid-19: la variante de doble mutación alimenta los temores". The Telegraph online . 17 de marzo de 2021.
^ "Linaje B.1.617.3". cov-lineages.org . Consultado el 10 de julio de 2021 .
^ ab Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. (abril de 2021). "Mapa completo de las mutaciones del RBD del SARS-CoV-2 que escapan al anticuerpo monoclonal LY-CoV555 y su cóctel con LY-CoV016". Cell Reports Medicine . 2 (4): 100255. doi : 10.1016/j.xcrm.2021.100255 . ISSN 2666-3791. PMC 8020059 . PMID 33842902.
^ Zhang, Wenjuan; Davis, Brian D.; Chen, Stephanie S.; Sincuir Martinez, Jorge M.; Plummer, Jasmine T.; Vail, Eric (6 de abril de 2021). "Aparición de una nueva variante del SARS-CoV-2 en el sur de California". JAMA . 325 (13): 1324–1326. doi : 10.1001/jama.2021.1612 . PMC 7879386 . PMID 33571356.
^ Koshy, Jacob (8 de abril de 2021). "Coronavirus | Cepa india 'doble mutante' denominada B.1.617". The Hindu . Consultado el 19 de abril de 2021. Aunque estas mutaciones se han encontrado individualmente en varias otras variantes del coronavirus, la presencia de ambas mutaciones juntas se ha encontrado por primera vez en algunos genomas de coronavirus de la India.
^ Greenwood, Michael (30 de marzo de 2021). "La mutación T478K del SARS-CoV-2 se está propagando a una velocidad alarmante en México". Noticias médicas . Consultado el 6 de septiembre de 2021 . La mutación T478K constituye el intercambio del aminoácido no cargado treonina por la lisina con carga positiva en la posición 478...
^ Delphine Planas (8 de julio de 2021). «Reducción de la sensibilidad de la variante Delta del SARS-CoV-2 a la neutralización de anticuerpos». Nature . 596 (7871): 276–280. Bibcode :2021Natur.596..276P. doi : 10.1038/s41586-021-03777-9 . PMID 34237773. S2CID 235775860. La mutación T478K en el RBD es exclusiva de la variante Delta...
^ ab Haseltine, William. "Una variante india del SARS-CoV-2 llega a California. ¿Se avecinan más peligros?". Forbes . Consultado el 20 de abril de 2021 .
^ "Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 a 3 de junio de 2021". Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades . Archivado desde el original el 11 de junio de 2021.
^ ab "Reacción de los expertos ante los casos de la variante B.1.617 (la 'variante india') que se están investigando en el Reino Unido". Science Media Centre . Consultado el 20 de abril de 2021 .
^ "Propuesta de nuevo sublinaje B.1 circulante en India #38". GitHub . Consultado el 2 de abril de 2021 .
^ "Posibles secuencias que deberían incluirse en B.1.617 #49". GitHub . Consultado el 28 de febrero de 2021 .
^ "Casos confirmados de variantes de COVID-19 identificados en el Reino Unido". www.gov.uk . 15 de abril de 2021. Archivado desde el original el 16 de abril de 2021. Este artículo incorpora texto publicado bajo la Licencia Británica de Gobierno Abierto v3.0:
^ "Casos confirmados de variantes de COVID-19 identificados en el Reino Unido". www.gov.uk . 3 de junio de 2021. Archivado desde el original el 4 de junio de 2021. Este artículo incorpora texto publicado bajo la Licencia Británica de Gobierno Abierto v3.0:
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