Variante Kappa del SARS-CoV-2

Tipo de virus detectado en 2020

La variante Kappa ^[1] es una variante del SARS-CoV-2 , el virus que causa la COVID-19 . Es uno de los tres sublinajes del linaje B.1.617 de Pango . La variante Kappa del SARS-CoV-2 también se conoce como linaje B.1.617.1 y se detectó por primera vez en la India en diciembre de 2020. ^[2] A fines de marzo de 2021, la subvariante Kappa representaba más de la mitad de las secuencias enviadas desde la India. ^[3] El 1 de abril de 2021, Public Health England la designó como variante bajo investigación ( VUI-21APR-01 ). ^[4]

Mutaciones

• 
  Mutaciones de aminoácidos de la variante Kappa del SARS-CoV-2 representadas en un mapa del genoma del SARS-CoV-2 con especial atención a la espícula. ^[5]

La variante Kappa tiene tres alteraciones notables en las secuencias de aminoácidos, todas ellas en el código de la proteína de pico del virus . ^[5]

Las tres sustituciones notables son: L452R, E484Q, P681R ^[8]

• L452R . La sustitución en la posición 452, una sustitución de leucina por arginina. Este intercambio confiere una mayor afinidad de la proteína de la espícula por el receptor ACE2 junto con una menor capacidad de reconocimiento del sistema inmunitario. ^{[9] [10]}
• E484Q . La sustitución en la posición 484, una sustitución de ácido glutámico por glutamina, confiere a la variante un mayor potencial de unión a la enzima convertidora de angiotensina 2 , así como una mejor capacidad para evadir los sistemas inmunológicos del huésped. ^{[11] [12]}
• P681R . La sustitución en la posición 681, una sustitución de prolina a arginina. ^{[13] [11]}

El Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades (ECDC) también enumera una cuarta mutación de interés: ^[14]

• D614G . Se trata de una sustitución en la posición 614, una sustitución de ácido aspártico por glicina. ^[15] Otras variantes que tienen la mutación D614G incluyen las variantes Beta y Delta , y la mutación está asociada con una mayor infectividad. ^{[16] [17]}

Las otras dos mutaciones que se pueden encontrar más cerca de cada extremo de la región de la espiga son T95I y Q1071H. ^[5]

Historia

Detección internacional

La variante Kappa se identificó por primera vez en la India en diciembre de 2020. ^[2]

Para el 11 de mayo de 2021, la Actualización Epidemiológica Semanal de la OMS había informado de 34 países con detecciones de la subvariante, ^[18] sin embargo, para el 25 de mayo de 2021, el número de países había aumentado a 41. ^{[19] [20]} Al 19 de mayo de 2021 ^[update], el Reino Unido había detectado un total de 418 casos confirmados de la variante Kappa del SARS-CoV-2. ^[21] El 6 de junio de 2021, un grupo de 60 casos identificados en la ciudad australiana de Melbourne estaban relacionados con la variante Kappa. ^[22] Según GISAID, en julio de 2021, la India había enviado más muestras genéticas de la variante Kappa que cualquier otro país. ^[23]

Transmisión comunitaria

En un documento técnico de Public Health England del 22 de abril de 2021 se informó de que se habían identificado 119 casos de la subvariante en Inglaterra, con una concentración de casos en el área de Londres y las regiones del noroeste y el este de Inglaterra. De los 119 casos, 94 tenían un vínculo establecido con viajes, 22 casos todavía estaban bajo investigación, pero se identificó que los 3 casos restantes no tenían ningún vínculo conocido con viajes. ^[6]

El 2 de junio, el periódico The Guardian informó que al menos 1 de cada 10 casos del brote en el estado australiano de Victoria se debieron al contacto con desconocidos y que la transmisión comunitaria estaba relacionada con grupos de la variante Kappa. Sin embargo, el experto en enfermedades infecciosas, el profesor Greg Dore, dijo que la variante Kappa se estaba comportando "de la misma manera que hemos visto antes" en relación con otras variantes en Australia. ^[24]

Eficacia de la vacuna

Las vacunas son eficaces contra la variante Kappa, aunque en menor medida que contra la cepa original. ^{[ cita requerida ]}

Un estudio realizado por la Universidad de Oxford en junio de 2021 afirmó que la vacuna Oxford-AstraZeneca y la vacuna Pfizer-BioNTech fueron efectivas contra las variantes Kappa y Delta, lo que sugiere que las vacunas actuales ofrecen protección contra estas variantes, aunque con ligeras reducciones en la neutralización. ^[25]

También se descubrió que la covaxina era eficaz contra la variante Kappa (B.1.617.1) al igual que contra otras variantes. ^[26]

También se descubrió que la vacuna Moderna contra la COVID-19 era eficaz contra la variante Kappa, aunque con una reducción de 3,3 a 3,4 veces en la neutralización. ^[27]

Estadística

Véase también

• Portal COVID-19
• Portal de medicina
• Portal de virus

• Variantes del SARS-CoV-2 : Alfa , Beta , Gamma , Delta , Epsilon , Zeta , Eta , Theta , Iota , Lambda , Mu , Ómicron

Referencias

1. "Seguimiento de las variantes del SARS-CoV-2". www.who.int . 31 de mayo de 2021 . Consultado el 5 de junio de 2021 .
2. «Actualización epidemiológica semanal sobre COVID-19 - 27 de abril de 2021» (PDF) . Organización Mundial de la Salud . 27 de abril de 2021. Consultado el 6 de junio de 2021 .
3. Le Page, Michael (4 de junio de 2021). «Variante india de covid-19 (B.1.617)». New Scientist . Consultado el 8 de junio de 2021 .
4. La Organización Mundial de la Salud la consideró una variante de interés que circulaba previamente en marzo de 2022. Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 y variantes bajo investigación en Inglaterra - Informe técnico n.º 10 (PDF) (Informe). Londres. 7 de mayo de 2021. Consultado el 5 de junio de 2021. Una variante detectada por primera vez en la India fue designada bajo investigación el 1 de abril de 2021 como VUI-21APR-01 (B.1.617.1). {{cite report}}: Parámetro desconocido |agency=ignorado ( ayuda )  Este artículo incorpora texto publicado bajo la Licencia Británica de Gobierno Abierto  v3.0:
5. "Variantes de Spike: variante Kappa, también conocida como B.1.617.1". covdb.stanford.edu . Base de datos de resistencia y antivirales del coronavirus de la Universidad de Stanford . 1 de julio de 2021 . Consultado el 3 de julio de 2021 .
6. Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 y variantes bajo investigación en Inglaterra - Informe técnico n.º 9 (PDF) (Informe). Londres. 22 de abril de 2021. Consultado el 9 de junio de 2021 . {{cite report}}: Parámetro desconocido |agency=ignorado ( ayuda )  Este artículo incorpora texto publicado bajo la Licencia Británica de Gobierno Abierto  v3.0:
7. "Compilación dedicada de Nextstrain 21A/S:154K". covariants.org . 8 de junio de 2021 . Consultado el 11 de junio de 2021 .
8. Nuki, Paul; Newey, Sarah (16 de abril de 2021). «La llegada de la 'doble mutación' de la India se suma a los problemas de las variantes, pero la amenaza que plantea sigue sin estar clara» . The Telegraph . ISSN  0307-1235. Archivado desde el original el 12 de enero de 2022 . Consultado el 7 de junio de 2021 .
9. Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. (abril de 2021). "Mapa completo de las mutaciones del RBD del SARS-CoV-2 que escapan al anticuerpo monoclonal LY-CoV555 y su cóctel con LY-CoV016". Cell Reports Medicine . 2 (4): 100255. doi : 10.1016/j.xcrm.2021.100255 . PMC 8020059 . PMID  33842902. 
10. Zhang, Wenjuan; Davis, Brian D.; Chen, Stephanie S.; Sincuir Martinez, Jorge M.; Plummer, Jasmine T.; Vail, Eric (6 de abril de 2021). "Aparición de una nueva variante del SARS-CoV-2 en el sur de California". JAMA . 325 (13): 1324–1326. doi : 10.1001/jama.2021.1612 . PMC 7879386 . PMID  33571356. 
11. Haseltine, William. "Una variante india del SARS-CoV-2 llega a California. ¿Se avecinan más peligros?". Forbes . Consultado el 7 de junio de 2021 .
12. Harvey, WT; Carabelli, AM; Jackson, B; Gupta, RK; Thomson, EC; Harrison, EM; et al. (2021). "Variantes del SARS-CoV-2, mutaciones de la espícula y escape inmunológico". Nat Rev Microbiol . 19 (7): 409–424. doi :10.1038/s41579-021-00573-0. PMC 8167834 . PMID  34075212. Por ejemplo, se anticipó que los virus del linaje B.1.617.1 detectados recientemente mostrarían una antigenicidad alterada debido a la presencia de las sustituciones L452R y E484Q, que se ha descrito que afectan el reconocimiento de anticuerpos. 
13. "Clasificaciones y definiciones de variantes del SARS-CoV-2". cdc.org . Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades . 11 de febrero de 2020 . Consultado el 7 de junio de 2021 .
14. "Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 a 3 de junio de 2021". Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades . 3 de junio de 2021 . Consultado el 8 de junio de 2021 .
15. Dr. Sanchari Sinha Dutta, Ph.D (15 de marzo de 2021). "Mutación D614G en la proteína Spike del SARS-CoV-2". News Medical . Consultado el 8 de junio de 2021 .
16. Korber, Bette; Fischer, Will M.; Gnanakaran, Sandrasegaram; Yoon, Hyejin; Theiler, James; Abfalterer, Werner; et al. (20 de agosto de 2020). "Seguimiento de los cambios en la proteína Spike del SARS-CoV-2: evidencia de que D614G aumenta la infectividad del virus de la COVID-19". Cell . 182 (4): 812–827. doi :10.1016/j.cell.2020.06.043. PMC 7332439 . PMID  32697968. 
17. "Clasificaciones y definiciones de variantes del SARS-CoV-2". cdc.gov . 4 de junio de 2021 . Consultado el 8 de junio de 2021 . Estas variantes comparten una mutación específica llamada D614G... ...Existe evidencia de que las variantes con esta mutación se propagan más rápidamente que los virus sin esta mutación.
18. "Actualización epidemiológica semanal sobre COVID-19 - 11 de mayo de 2021" (PDF) . Organización Mundial de la Salud . 11 de mayo de 2021. p. 4 . Consultado el 8 de junio de 2021 .
19. "Actualización epidemiológica semanal sobre COVID-19 - 25 de mayo de 2021" (PDF) . Organización Mundial de la Salud . 25 de mayo de 2021. p. 10 . Consultado el 8 de junio de 2021 .
20. "La variante B.1.617 de Covid, encontrada por primera vez en India, ahora está presente en 53 países: OMS". Business Standard . India. 27 de mayo de 2021 . Consultado el 8 de junio de 2021 . Según este, la variante B.1.617.1 se encuentra en 41 países...
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22. Taylor, Josh (6 de junio de 2021). "¿De dónde vinieron los primeros casos de la variante Delta de Covid en Australia y qué tan infecciosa es?". The Guardian . Melbourne . Consultado el 8 de junio de 2021 .
23. Baro, Dimple (11 de julio de 2021). "Todo lo que necesita saber sobre la variante Kappa de COVID-19". EastMojo .
24. Davey, Melissa (2 de junio de 2021). "Los expertos cuestionan la afirmación de Victoria de que la variante Kappa es más infecciosa que los brotes anteriores de Covid". The Guardian . Victoria . Consultado el 9 de junio de 2021 .
25. "Coronavirus: las vacunas de AstraZeneca y Pfizer son eficaces contra las variantes Delta y Kappa, según un estudio". 23 de junio de 2021.
26. "La covacuna neutraliza la cepa doble mutante del SARS-CoV-2: estudio del ICMR". 21 de abril de 2021.
27. "Estudios pequeños indican que la vacuna contra la COVID-19 de Moderna puede ser eficaz contra las variantes Delta, Kappa y Eta". Julio de 2021.
28. "GISAID - Variantes del virus hCov19" www.gisaid.org . Consultado el 13 de septiembre de 2021 .