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Código filogenético

El Código Internacional de Nomenclatura Filogenética , conocido como PhyloCode para abreviar, es un conjunto formal de reglas que rigen la nomenclatura filogenética . Su versión actual está diseñada específicamente para regular la denominación de clados , dejando la gobernanza de los nombres de especies en manos de los códigos de nomenclatura basados ​​en rangos ( ICN , ICNCP , ICNP , ICZN , ICVCN ).

El PhyloCode está asociado con la Sociedad Internacional de Nomenclatura Filogenética (ISPN). [1] El volumen complementario, Phylonyms , establece 300 nombres de taxones bajo PhyloCode , que sirven como ejemplos para aquellos que no están familiarizados con el código. [2] RegNum es una base de datos en línea asociada para nombres de clados registrados. [3]

El PhyloCode regula la nomenclatura filogenética al proporcionar reglas para decidir qué asociaciones de nombres y definiciones se consideran establecidas, [4] cuáles de ellas se considerarán homónimas [5] o sinónimos, [6] y cuál de un conjunto de sinónimos u homónimos se considerará aceptado (generalmente el registrado primero; ver más abajo). El PhyloCode solo rige la denominación de clados , [7] no de grupos parafiléticos o polifiléticos , y solo permite el uso de especímenes , especies y apomorfías como especificadores (anclajes). [8]

Nomenclatura filogenética

A diferencia de los códigos de nomenclatura basados ​​en rangos ( ICN , ICZN , ICNB ), el PhyloCode no requiere el uso de rangos , aunque permite opcionalmente su uso. [9] [10] Los códigos basados ​​en rangos definen taxones utilizando un rango (como género , familia , etc.) y, en muchos casos, un espécimen tipo o un subtaxón tipo . El contenido exacto de un taxón, aparte del tipo, no está especificado por los códigos basados ​​en rangos.

En cambio, en la nomenclatura filogenética, el contenido de los taxones se delimita utilizando una definición que se basa en la filogenia (es decir, ascendencia y descendencia) y utiliza especificadores (por ejemplo, especies, especímenes, apomorfías) para indicar organismos reales . La fórmula de la definición indica un ancestro. El taxón definido, entonces, es ese ancestro y todos sus descendientes. Por lo tanto, el contenido de un taxón definido filogenéticamente se basa en una hipótesis filogenética.

Los siguientes son ejemplos de tipos de definición filogenética (las letras mayúsculas indican especificadores): [11]

También son posibles otros tipos de definición, teniendo en cuenta no sólo las relaciones filogenéticas y apomorfías de los organismos, sino también si existen o no organismos relacionados .

La siguiente tabla ofrece ejemplos de definiciones filogenéticas de clados que también tienen rangos en la nomenclatura tradicional. Cuando todos los especificadores en una definición basada en nodos son especímenes o especies existentes, como en la siguiente definición de Mammalia, se define un grupo corona . (La definición tradicional de Mammalia es menos restrictiva e incluye algunos grupos fósiles fuera del grupo corona). [12]

Versiones

PhyloCode ha pasado por varias revisiones. A partir de noviembre de 2023 , la versión actual es la 6, publicada en el sitio web el 8 de junio de 2020.

Organización

Al igual que en otros códigos nomenclaturales, las reglas del PhyloCode están organizadas en artículos, que a su vez están organizados en capítulos. Cada artículo puede contener también notas, ejemplos y recomendaciones.

Tabla de contenido

Base de datos de registro

Una vez implementado, el PhyloCode se asociará con una base de datos de registro , llamada RegNum, que almacenará todos los nombres de clados y definiciones que se considerarán aceptables. [13] Se espera que esto proporcione una herramienta de uso público para asociar nombres de clados con definiciones, que luego podrían asociarse con conjuntos de subtaxones o especímenes a través de bases de datos de árboles filogenéticos (como TreeBASE ).

Sin embargo, tal como está previsto actualmente, el uso más importante de RegNum será la decisión de cuál de varios sinónimos u homónimos se considerará aceptado: el que tenga el número de registro más bajo, excepto en casos de conservación.

Historia

(Condensado del Prefacio del PhyloCode . [14] )

El PhyloCode surgió de un taller celebrado en la Universidad de Harvard en agosto de 1998, en el que se tomaron decisiones sobre su alcance y contenido. Muchos de los participantes del taller, junto con otras personas que posteriormente se sumaron al proyecto, actuaron como grupo asesor. En abril de 2000, se publicó un borrador en la web y se solicitaron comentarios de la comunidad científica.

En julio de 2002 se celebró un segundo taller en la Universidad de Yale , en el que se introdujeron algunas modificaciones en las normas y recomendaciones del PhyloCode . También se han realizado otras revisiones de vez en cuando.

La Primera Reunión Internacional de Nomenclatura Filogenética, que tuvo lugar del 6 al 9 de julio de 2004 en París , Francia , contó con la asistencia de unos 70 biólogos sistemáticos y evolutivos de 11 naciones. [15] Esta fue la primera conferencia abierta de varios días que se centró completamente en la nomenclatura filogenética , y proporcionó el lugar para la inauguración de una nueva asociación, la Sociedad Internacional de Nomenclatura Filogenética (ISPN). Los miembros de la ISPN eligen al Comité de Nomenclatura Filogenética (CPN), que ha asumido el papel del grupo asesor que supervisó las primeras etapas del desarrollo del PhyloCode.

La Segunda Reunión Internacional de Nomenclatura Filogenética tuvo lugar del 28 de junio de 2006 al 2 de julio de 2006 en la Universidad de Yale ( New Haven , Connecticut , EE. UU.). [16]

La Tercera Reunión Internacional de Nomenclatura Filogenética tuvo lugar del 21 al 22 de julio de 2008 en la Universidad de Dalhousie ( Halifax , Nueva Escocia , Canadá). [17]

El PhyloCode entró en vigor con la publicación del volumen complementario, Phylonyms , en 2020. [18]

Influencias

La base teórica del PhyloCode fue desarrollada en una serie de artículos de de Queiroz y Gauthier , [19] [20] [21] que fue anticipada por sugerencias anteriores de que un nombre de taxón podría definirse por referencia a una parte de un árbol filogenético . [22] [23]

Siempre que fue posible, los autores del PhyloCode utilizaron como modelo el borrador del BioCode [24], que intentaba unificar el enfoque basado en rangos en un solo código. Por lo tanto, la organización del PhyloCode , parte de su terminología y la redacción de ciertas reglas se derivan del BioCode . Otras reglas se derivan de uno o más de los códigos basados ​​en rangos, en particular los códigos botánico [25] [26] [27] y zoológico [28] [29] . Sin embargo, muchas reglas del PhyloCode no tienen equivalente en ningún código basado en rangos taxonómicos debido a diferencias fundamentales en los fundamentos de definición de los sistemas alternativos. Obsérvese que el PhyloCode no rige los nombres de las especies, cuyas reglas de disponibilidad, tipificación, etc., siguen estando reguladas por el Código de nomenclatura tradicional requerido.

Futuro

El PhyloCode es controvertido y ha inspirado considerables críticas de algunos taxónomos. [30] Aunque se inauguró hace décadas, el número de partidarios de la adopción generalizada del PhyloCode todavía es pequeño, y la publicación de literatura sobre el PhyloCode se estancó a mediados de la década de 2010, [31] antes de acelerarse después de la publicación de Phylonyms en 2020 y del lanzamiento del Bulletin of Phylogenetic Nomenclature, que es una revista dedicada a la publicación de actos nomenclaturales (especialmente la definición de nombres de taxones) válidos bajo el PhyloCode . [32] [33] Para ser válidos bajo el PhyloCode, los nombres de taxones y las definiciones asociadas deben estar registrados en la base de datos RegNum.

Se puede encontrar una lista de críticas publicadas del PhyloCode en el sitio web de ISPN, así como una lista de refutaciones.

Referencias

  1. ^ "Sociedad Internacional de Nomenclatura Filogenética (sitio web)". Phylonames.org . Consultado el 7 de julio de 2010 .
  2. ^ Laurin, M.; Bryant, HN (2009). "Tercera reunión de la Sociedad Internacional de Nomenclatura Filogenética: un informe". Zoologica Scripta . 38 (3): 333–337. doi :10.1111/j.1463-6409.2008.00379.x. S2CID  221171579.
  3. ^ "RegNum". Museo de Florida . Consultado el 4 de abril de 2019 .
  4. ^ "Código internacional de nomenclatura filogenética, versión 4b - Capítulo II. Publicación". Ohiou.edu . Consultado el 7 de julio de 2010 .
  5. ^ "Código internacional de nomenclatura filogenética, versión 4b - Artículo 13: Homonimia". ohiou.edu . Consultado el 7 de julio de 2010 .
  6. ^ "Código internacional de nomenclatura filogenética, versión 4b, artículo 14: Sinonimia". Ohiou.edu . Consultado el 7 de julio de 2010 .
  7. ^ "Código internacional de nomenclatura filogenética, versión 4b - Regla 1.1". Ohiou.edu . Consultado el 7 de julio de 2010 .
  8. ^ "Código internacional de nomenclatura filogenética, versión 4b - Artículo 11. Especificadores y cláusulas calificativas". Ohiou.edu . Consultado el 7 de julio de 2010 .
  9. ^ "Código internacional de nomenclatura filogenética, versión 4b - Artículo 3. Jerarquía y rango". Ohiou.edu . Consultado el 7 de julio de 2010 .
  10. ^ Aunque tenga en cuenta que el PhyloCode no permite que el nombre de un taxón cambie cuando cambia su rango, mientras que los códigos basados ​​en rango requieren esto para al menos algunos nombres.
  11. ^ "Código internacional de nomenclatura filogenética, versión 4b - Artículo 9. Requisitos generales para el establecimiento de nombres de clados". Ohiou.edu . Consultado el 7 de julio de 2010 .
  12. ^ Anderson, Jason S. (2002). "Uso de nombres conocidos en la nomenclatura filogenética: una respuesta a Laurin". Biología sistemática . 51 (5): 822–827. doi : 10.1080/10635150290102447 . PMID  12396594.
  13. ^ "El FiloCódigo: Artículo 8".
  14. ^ "Código internacional de nomenclatura filogenética, versión 4b - Prefacio". Ohiou.edu . Consultado el 7 de julio de 2010 .
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  17. ^ Laurin, M.; Bryant, HN (mayo de 2009). "Tercera reunión de la Sociedad Internacional de Nomenclatura Filogenética: un informe". Zoologica Scripta . 38 (3): 333–337. doi :10.1111/j.1463-6409.2008.00379.x. S2CID  221171579.
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Literatura

Enlaces externos