cromosoma humano
El cromosoma 4 es uno de los 23 pares de cromosomas de los humanos . Las personas normalmente tienen dos copias de este cromosoma. El cromosoma 4 abarca más de 193 millones de pares de bases (el material de construcción del ADN ) y representa entre el 6 y el 6,5 por ciento del ADN total de las células .
genómica
El cromosoma tiene ~193 megabases de longitud. En un artículo de 2012, se identificaron 775 genes que codifican proteínas en este cromosoma. [4] 211 (27,9%) de estas secuencias codificantes no tenían ninguna evidencia experimental a nivel de proteína, en 2012. 271 parecen ser proteínas de membrana. 54 han sido clasificadas como proteínas asociadas al cáncer.
genes
Número de genes
Las siguientes son algunas de las estimaciones del recuento de genes del cromosoma 4 humano. Debido a que los investigadores utilizan diferentes enfoques para la anotación del genoma, sus predicciones sobre la cantidad de genes en cada cromosoma varían (para obtener detalles técnicos, consulte predicción de genes ). Entre varios proyectos, el proyecto colaborativo de secuencia de codificación por consenso ( CCDS ) adopta una estrategia extremadamente conservadora. Por lo tanto, la predicción del número de genes del CCDS representa un límite inferior en el número total de genes que codifican proteínas humanas. [5]
lista de genes
La siguiente es una lista parcial de genes en el cromosoma 4 humano. Para obtener una lista completa, consulte el enlace en el cuadro de información a la derecha.
- AASDH : aminoadipato-semialdehído deshidrogenasa
- ACVR1 : quinasa tipo activina 2 (ALK-2)
- ACOX3 : enzima codificante acil-coenzima A oxidasa 3 peroxisomal
- AFAP1-AS1 : proteína codificante AFAP1 ARN antisentido 1
- AGA : gen relacionado con el síndrome AGU (enfermedad de la herencia finlandesa)
- AGPAT9 : enzima codificante Glicerol-3-fosfato aciltransferasa 3 también conocida como 1-acilglicerol-3-fosfato O-aciltransferasa 9
- ANK2 : anquirina 2, neuronal
- APBB2 : proteína codificante miembro 2 de la familia B de unión a proteínas precursoras de amiloide beta A4
- ART3 : enzima codificante Ecto-ADP-ribosiltransferasa 3
- ASAHL : enzima codificante de la amidasa del ácido hidrolizante de N-aciletanolamina
- BANK1 : proteína codificante de proteína de andamio de células B con repeticiones de anquirina 1
- BEND4 : proteína codificante del dominio BEN que contiene 4
- CCDC109B : dominio en espiral que contiene 109B
- CLNK : proteína codificante enlazador de células hematopoyéticas dependiente de citoquinas
- Factor de complemento I : Factor de complemento I
- COL25A1-DT : proteína codificante Dedo de zinc, dominio cchc que contiene 23
- CRMP1 : proteína 1 mediadora de la respuesta de colapsina, miembro de la familia CRMP
- CSN2 : Beta-caseína
- CXCL1 : ligando 1 de quimiocina (motivo CXC), scyb1
- CXCL2 : ligando 2 de quimiocina (motivo CXC), scyb2
- CXCL3 : ligando 3 de quimiocina (motivo CXC), scyb3
- CXCL4 : ligando 4 de quimiocina (motivo CXC), factor plaquetario 4, PF-4, scyb4
- CXCL5 : ligando 5 de quimiocina (motivo CXC), scyb5
- CXCL6 : ligando 6 de quimiocina (motivo CXC), scyb6
- CXCL7 : ligando 7 de quimiocina (motivo CXC), PPBP, scyb7
- CXCL8 : ligando 8 de quimiocina (motivo CXC), interleucina 8 (IL-8), scyb8
- CXCL9 : ligando 9 de quimiocina (motivo CXC), scyb9
- CXCL10 : ligando 10 de quimiocina (motivo CXC), scyb10
- CXCL11 : ligando 11 de quimiocina (motivo CXC), scyb11
- CXCL13 : ligando 13 de quimiocina (motivo CXC), scyb13
- CYTL1 : tipo citocina 1
- DCUN1D4 : Defectuoso en el dominio cullin neddylation 1 que contiene 4
- DHX15 : helicasa 15 de caja DEAH
- DKK2 : proteína 2 relacionada con Dickkopf
- DMAC1 : proteína codificante Proteína transmembrana 261
- DUX4 : Se cree que está inactivo, pero una investigación de 2010 muestra un papel clave en FSHD [12]
- ELMOD2 : dominio Elmo que contiene 2
- EMCN : endomucina
- EVC : síndrome de Ellis-Van Creveld
- EVC2 : síndrome de Ellis-Van Creveld 2 ( limbina )
- Factor XI : las mutaciones causan la hemofilia C
- FAM114A1 : Familia con similitud de secuencia 114, miembro A1
- FAM149A : Familia con similitud de secuencia 149, miembro A
- FAM193A : Familia con similitud de secuencia 193, miembro A
- FAM198B : proteína codificante Proteína ENED
- FAM221B : Familia con similitud de secuencia 221, miembro B
- FAM47E-STBD1 : lectura completa de FAM47E-STBD1
- FGF2 : factor de crecimiento de fibroblastos 2 ( factor de crecimiento de fibroblastos básico )
- FGFR3 : receptor 3 del factor de crecimiento de fibroblastos ( acondroplasia , enanismo tanatofórico , cáncer de vejiga )
- FGFRL1 : receptor tipo 1 del factor de crecimiento de fibroblastos
- FRG1 : gen 1 de la región FSHD
- FRYL : proteína codificante FRY como coactivador de transcripción
- FSTL5 : proteína codificante folistatina como 5
- GUF1 : homólogo de GUF1, GTPasa
- HDL3 : codifica la proteína 2 del trastorno neurodegenerativo similar a Huntington
- HELQ : proteína codificante Helicasa, similar a POLQ
- HTT (Huntingtin): proteínahuntingtina ( enfermedad de Huntington )
- IGJ : proteína conectora para polipéptidos alfa y mu de inmunoglobulina
- INTS12 : subunidad 12 del complejo integrador
- KDR : Receptor de dominio de inserción de quinasa ( receptor 2 del factor de crecimiento endotelial vascular )
- KIAA1530 : proteína A de andamio estimulada por UV
- LCORL : Correpresor del receptor nuclear dependiente de ligando como
- LDB2 : proteína 2 de unión al dominio LIM
- LGI2 : miembro 2 de la familia LGI repetido rico en leucina
- LOC100505912 proteína codificante LOC100505912 no caracterizado
- LSM6 : proteína similar a Sm asociada al ARNsn U6
- LTO1P1 : proteína codificante Cáncer oral sobreexpresado 1 pseudogen 1
- LYAR : Proteína nucleolar reguladora del crecimiento celular
- MAB21L2 : Mab-21-like 2
- Marcksl1 : proteína codificante tipo MARCKS 1
- MAML3 : Mastermind-like 3
- MFSD7 : proteína codificante Dominio de superfamilia facilitador principal que contiene 7
- MIR1269A : microARN 1269a
- MIR95 : ARN no codificante MicroARN 95
- MLF1IP : Proteína U centrómero
- MMAA : aciduria metilmalónica ( deficiencia de cobalamina ) tipo cblA
- MTHFD2L : proteína similar a la metilenetetrahidrofolato deshidrogenasa 2 dependiente de NAD
- MYL5 : cadena ligera de miosina 5
- NAP1L5 : proteína codificante de la proteína de ensamblaje de nucleosomas 1 como 5
- NDNF : proteína codificante Factor neurotrófico derivado de neuronas
- NOA1 : proteína codificante asociada al óxido nítrico 1
- NPNT : proteína codificante nefronectina
- NUDT6 : nudix hidrolasa 6
- NUDT9 : nudix hidrolasa 9
- OTUD4 : proteína 4 que contiene el dominio OTU
- PABPC4L : proteína codificante Proteína de unión poli(A), tipo 4 citoplasmática
- PARM1 : Proteína 1 similar a la mucina regulada por andrógenos prostáticos
- PHOX2B : códigos para un factor de transcripción de homeodominio
- PI4K2B : Fosfatidilinositol 4-quinasa tipo 2-beta
- PKD2 : enfermedad renal poliquística 2 ( autosómica dominante )
- PLAC8 : proteína codificante específica de la placenta 8
- PLK4 : Serina/treonina-proteína quinasa PLK4
- PPEF2 : proteína codificante Proteína fosfatasa con dominio ef-hand 2
- PSAPL1 : proteína codificante similar a la prosaposina 1 (gen/pseudogén)
- QDPR : dihidropteridina reductasa quinoide
- RBM47 : proteína 47 con motivo de unión a ARN
- RG9MTD2 : proteína codificante del dominio de ARN (guanina-9-) metiltransferasa que contiene 2
- SCRG1 : proteína codificante estimuladora de la condrogénesis 1
- SDAD1 : homólogo de proteína SDA1
- SEC24B : homólogo B de Sec24
- SEC24D : homólogo D de Sec24
- SEPT11 : Septin-11
- SLC9B2 : familia de portadores de solutos de 9 miembros B2
- SLC10A4 : familia de portadores de solutos 10 miembros 4
- SMIM20 : proteína codificante Proteína de membrana integral pequeña 20
- SNCA : sinucleína , alfa (componente no A4 del precursor de amiloide)
- SPATA5 : proteína 5 asociada a la espermatogénesis
- STATH : gen con producto proteico
- TACC3 : Transformación de la proteína 3 que contiene bobinas en espiral ácidas
- TENM3 : proteína transmembrana teneurina 3
- THAP6 : proteína 6 que contiene el dominio THAP
- TMEM155 : proteína codificante Proteína transmembrana 155
- TMEM165 : proteína codificante Proteína transmembrana 165
- TMEM175 : proteína codificante Proteína transmembrana 175
- TMEM243 : proteína codificante Proteína transmembrana 243
- TMPRSS11D : proteasa transmembrana, serina 11D
- TMPRSS11F : proteína codificante serina proteasa transmembrana 11F
- TNIP2 : proteína 2 de interacción TNFAIP3
- TNIP3 : proteína codificante TNFAIP3 que interactúa con la proteína 3
- UCHL1 : ubiquitina carboxil-terminal esterasa L1 ( ubiquitina tiolesterasa )
- UGDH-AS1 : proteína codificante UGDH ARN antisentido 1
- UGT8 : UDP glicosiltransferasa 8
- UNC5C : receptor de netrina UNC5C
- UPF0602 : codificación de la proteína C4orf47 UPF0602
- USP38 : proteína codificante de peptidasa 38 específica de ubiquitina
- USP53 : peptidasa específica de ubiquitina 53
- UTP3 : componente del procesoma de subunidad pequeña
- VPS54
- WFS1 : síndrome de Wolfram 1 (wolframina)
- ZGRF1 : tipo GRF con dedos de zinc que contiene 1
- ZNF621 : proteína codificante Proteína de dedos de zinc 621
Enfermedades y trastornos
Las siguientes son algunas de las enfermedades relacionadas con genes ubicados en el cromosoma 4:
banda citogenética
Referencias
- ^ ab "Resultados de la búsqueda - 4[CHR] Y "Homo sapiens"[Organismo] Y ("tiene ccds"[Propiedades] Y vivo[prop]) - Gene". NCBI . CCDS Versión 20 para Homo sapiens . 2016-09-08 . Consultado el 28 de mayo de 2017 .
- ^ Tom Strachan; Andrew Read (2 de abril de 2010). Genética molecular humana. Ciencia de la guirnalda. pag. 45.ISBN 978-1-136-84407-2.
- ^ ab Página de decoración del genoma, NCBI. Datos de ideograma para Homo sapience (850 bphs, Asamblea GRCh38.p3). Última actualización 2014-06-03. Consultado el 26 de abril de 2017.
- ^ Chen LC, Liu MY, Hsiao YC, Choong WK, Wu HY, Hsu WL, Liao PC, Sung TY, Tsai SF, Yu JS, Chen YJ (2012) Decodificación de las proteínas asociadas a enfermedades codificadas en el cromosoma humano 4. J Res del proteoma
- ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). "Entre un pollo y una uva: estimando el número de genes humanos". Genoma Biol . 11 (5): 206. doi : 10.1186/gb-2010-11-5-206 . PMC 2898077 . PMID 20441615.
- ^ "Estadísticas y descargas del cromosoma 4". Comité de Nomenclatura Genética de HUGO . 2017-05-12. Archivado desde el original el 29 de junio de 2017 . Consultado el 19 de mayo de 2017 .
- ^ "Cromosoma 4: resumen de cromosomas - Homo sapiens". Lanzamiento del conjunto 88 . 2017-03-29 . Consultado el 19 de mayo de 2017 .
- ^ "Cromosoma 4 humano: entradas, nombres de genes y referencias cruzadas a MIM". UniProt . 2018-02-28 . Consultado el 16 de marzo de 2018 .
- ^ "Resultados de la búsqueda - 4 [CHR] Y" Homo sapiens "[Organismo] Y ("codificación de proteína tipo genético" [Propiedades] Y vivo [prop]) - Gen". NCBI . 2017-05-19 . Consultado el 20 de mayo de 2017 .
- ^ "Resultados de la búsqueda - 4[CHR] AND "Homo sapiens"[Organismo] AND ( ("genetype miscrna"[Propiedades] OR "genetype ncrna"[Propiedades] OR "genetype rrna"[Propiedades] OR "genetype trna"[Propiedades] ] O "genetipo scrna"[Propiedades] O "genetipo snrna"[Propiedades] O "genetipo snorna"[Propiedades]) NO "codificación de proteína del gentipo"[Propiedades] Y vivo[prop]) - Gen". NCBI . 2017-05-19 . Consultado el 20 de mayo de 2017 .
- ^ "Resultados de la búsqueda - 4 [CHR] Y" Homo sapiens "[Organismo] Y ("genetipo pseudo" [Propiedades] Y vivo [prop]) - Gen". NCBI . 2017-05-19 . Consultado el 20 de mayo de 2017 .
- ^ Lemmers RJ, van der Vliet PJ, Klooster R, Sacconi S, Camaño P, Dauwerse JG, Snider L, Straasheijm KR, van Ommen GJ, Padberg GW, Miller DG, Tapscott SJ, Tawil R, Frants RR, van der Maarel SM (Septiembre de 2010). "Un modelo genético unificador para la distrofia muscular facioescapulohumeral". Ciencia . 329 (5999): 1650–3. Código Bib : 2010 Ciencia... 329.1650L. doi : 10.1126/ciencia.1189044. PMC 4677822 . PMID 20724583.
- ^ Página de decoración del genoma, NCBI. Datos de ideograma para Homo sapience (400 bphs, Asamblea GRCh38.p3). Última actualización 2014-03-04. Consultado el 26 de abril de 2017.
- ^ Página de decoración del genoma, NCBI. Datos de ideograma para Homo sapience (550 bphs, Asamblea GRCh38.p3). Última actualización 2015-08-11. Consultado el 26 de abril de 2017.
- ^ Comité Internacional Permanente sobre Nomenclatura Citogenética Humana (2013). ISCN 2013: Un sistema internacional de nomenclatura citogenética humana (2013). Editores médicos y científicos de Karger. ISBN 978-3-318-02253-7.
- ^ Sethakulvichai, W.; Manitpornsut, S.; Wiboonrat, M.; Lilakiatsakun, W.; Assawamakin, A.; Tongsima, S. (2012). "Estimación de resoluciones a nivel de banda de imágenes de cromosomas humanos". 2012 Novena Conferencia Internacional sobre Ciencias de la Computación e Ingeniería de Software (JCSSE) . págs. 276–282. doi :10.1109/JCSSE.2012.6261965. ISBN 978-1-4673-1921-8. S2CID 16666470.
- ^ Página de decoración del genoma, NCBI. Datos de ideograma para Homo sapience (850 bphs, Asamblea GRCh38.p3). Última actualización 2014-06-03. Consultado el 26 de abril de 2017.
- ^ " p ": brazo corto; " q ": Brazo largo.
- ^ Para conocer la nomenclatura de bandas citogenéticas, consulte el artículo locus .
- ^ ab Estos valores (ISCN inicio/parada) se basan en la longitud de las bandas/ideogramas del libro ISCN, Un sistema internacional para la nomenclatura citogenética humana (2013). Unidad arbitraria .
- ^ gpos : región teñida positivamente por bandas G , generalmente rica en AT y pobre en genes; gnega : región teñida negativamente por las bandas G, generalmente rica en CG y rica en genes; acen Centrómero . var : región variable; tallo : tallo.
Otras lecturas
- Goldfrank D, Schoenberger E, Gilbert F (2003). "Genes y cromosomas de enfermedades: mapas de enfermedades del genoma humano. Cromosoma 4". Prueba genética . 7 (4): 351–72. doi :10.1089/109065703322783752. PMID 15000816.
- Hillier LW, Graves TA, Fulton RS, Fulton LA, Pepin KH, Minx P, et al. (Abril de 2005). "Generación y anotación de las secuencias de ADN de los cromosomas 2 y 4 humanos". Naturaleza . 434 (7034): 724–31. Código Bib :2005Natur.434..724H. doi : 10.1038/naturaleza03466 . PMID 15815621.
enlaces externos
Wikimedia Commons tiene medios relacionados con el cromosoma 4 humano .
- Institutos Nacionales de Salud. "Cromosoma 4". Referencia del hogar de genética . Archivado desde el original el 3 de agosto de 2004 . Consultado el 6 de mayo de 2017 .
- "Cromosoma 4". Archivo de información del Proyecto Genoma Humano 1990-2003 . Consultado el 6 de mayo de 2017 .