stringtranslate.com

ARN bicatenario

Estructura de ARN bicatenario

El ARN bicatenario (ARNds) es un ARN con dos hebras complementarias que se encuentra en las células. Es similar al ADN pero con la sustitución de la timina por uracilo y la adición de un átomo de oxígeno. [1] A pesar de las similitudes estructurales, se sabe mucho menos sobre el ARNbc. [2]

Forman el material genético de algunos virus ( virus de ARN bicatenario ). El ARNds, como el ARN viral o el ARNip , puede desencadenar la interferencia del ARN en eucariotas , así como la respuesta al interferón en los vertebrados . [3] [4] [5] En eucariotas, el ARNbc desempeña un papel en la activación del sistema inmunológico innato contra infecciones virales. [1]

Historia del descubrimiento

Watson y Crick habían observado desde el principio que el grupo 2' hidroxilo de cada nucleótido de ARN impediría que el ARN formara una doble hélice similar a la que habían descrito para el ADN. [6]

En 1995, Alexander Rich y David R. Davies propusieron por primera vez la estructura de doble hélice del ARN. [7]

Estructura

El ARN de alto peso molecular en forma 'A' se denomina ARNbc y posee las siguientes características:

Estas características se encuentran en los genomas de varios organismos, así como en el ARN bicatenario que anteriormente se denominaba "forma replicativa" y posteriormente se pensó que era un subproducto de la replicación del ARN del fago. Alternativamente, se encuentran en complejos de polirribonucleótidos bicatenarios artificiales de alto peso molecular, como los complejos poli(A) · poli(U) o poli(I) · poli(C).

Las formas ácidas ampliamente reconocidas de poliadenilato y policitidilato se pueden introducir en estas especies canónicas de ARN bicatenario. Debido a que las bases de estos polirribonucleótidos están protonadas a valores de pH inferiores a los valores de pK de la adenina y la citosina, asumen una estructura bicatenaria bien caracterizada [y para el poli(A) particularmente estable] a niveles de pH ácidos.

Las secuencias autocomplementarias más o menos abundantes que se encuentran en todas las demás formas de ARN, incluidos el ARNr, el ARNm, el ARNt, el ARN viral monocatenario y el ARN viroide, también pueden formar estructuras secundarias de doble hélice, aunque incompletas y/o irregulares. [8]

Fuentes

Los retrovirus endógenos, los pares de transcritos sentido-antisentido naturales, los transcritos mitocondriales y las secuencias nucleares repetitivas, incluidos elementos intercalados cortos y largos ( SINE y LINE ), son algunas de las fuentes principales de ARNbc endógeno. [9]

Propiedades

En general, los dsRNA comparten algunas características importantes:

Los dsRNA varían en tamaño de 1,5 a 20 kpb. Los dsRNA más pequeños (<2,0 kpb) se asocian frecuentemente con partículas similares a virus , y algunos de estos dsRNA ya han sido identificados como virus pertenecientes a la familia Partitiviridae . Por lo general, tienen dos segmentos de ARNbc lineales distintos, cada uno de aproximadamente 2,0 kpb de longitud. Es poco probable que segmentos de más de 10 kpb estén vinculados a partículas similares a virus específicas, ya que no se han identificado partículas similares a virus únicas en muestras preparadas mediante diversas técnicas de purificación. Por esta razón, estos grandes dsRNA se denominaban anteriormente dsRNA enigmáticos, dsRNA endógenos o plásmidos de ARN. [10]

Referencias

  1. ^ ab Whitehead KA, Dahlman JE, Langer RS, Anderson DG (15 de julio de 2011). "¿Silenciamiento o estimulación? Entrega de ARNip y el sistema inmunológico". Revista Anual de Ingeniería Química y Biomolecular . 2 (1): 77–96. doi :10.1146/annurev-chembioeng-061010-114133. PMID  22432611.
  2. ^ Lipfert J, Skinner GM, Keegstra JM, Hensgens T, Jager T, Dulin D, et al. (octubre de 2014). "ARN bicatenario bajo fuerza y ​​torsión: similitudes y diferencias sorprendentes con el ADN bicatenario". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 111 (43): 15408–15413. Código Bib : 2014PNAS..11115408L. doi : 10.1073/pnas.1407197111 . PMC 4217419 . PMID  25313077. 
  3. ^ Schultz U, Kaspers B, Staeheli P (mayo de 2004). "El sistema de interferón de vertebrados no mamíferos". Inmunología comparada y del desarrollo . 28 (5): 499–508. doi :10.1016/j.dci.2003.09.009. PMID  15062646.
  4. ^ Weber F, Wagner V, Rasmussen SB, Hartmann R, Paludan SR (mayo de 2006). "El ARN de doble cadena es producido por virus de ARN de cadena positiva y virus de ADN, pero no en cantidades detectables por virus de ARN de cadena negativa". Revista de Virología . 80 (10): 5059–5064. doi :10.1128/JVI.80.10.5059-5064.2006. PMC 1472073 . PMID  16641297. 
  5. ^ Jana S, Chakraborty C, Nandi S, Deb JK (noviembre de 2004). "Interferencia de ARN: posibles dianas terapéuticas". Microbiología y Biotecnología Aplicadas . 65 (6): 649–657. doi :10.1007/s00253-004-1732-1. PMID  15372214.
  6. ^ Salazar M, Fedoroff OY, Miller JM, Ribeiro NS, Reid BR (abril de 1993). "La cadena de ADN en los dúplex híbridos ADN.ARN no tiene forma B ni forma A en solución". Bioquímica . 32 (16): 4207–4215. doi :10.1021/bi00067a007. PMID  7682844.
  7. ^ Zhang S, Wittig B (junio de 2015). "Alejandro rico 1924-2015". Biotecnología de la Naturaleza . 33 (6): 593–598. doi :10.1038/nbt.3262. PMID  26057974.
  8. ^ abc Libonati M, Sorrentino S (2001). "Degradación del ARN bicatenario por ribonucleasas de tipo pancreático de mamíferos". Métodos en enzimología. vol. 341. Elsevier. págs. 234-248. doi :10.1016/s0076-6879(01)41155-4. ISBN 978-0-12-182242-2. PMID  11582780 . Consultado el 7 de junio de 2024 .
  9. ^ Sadeq S, Al-Hashimi S, Cusack CM, Werner A (febrero de 2021). "ARN bicatenario endógeno". ARN no codificante . 7 (1): 15. doi : 10.3390/ncrna7010015 . PMC 7930956 . PMID  33669629. 
  10. ^ Fukuhara T, Moriyama H (2008). "Endornavirus". En Mahy BW, Van Regenmortel MH (eds.). Enciclopedia de Virología (3ª ed.). Ámsterdam: Elsevier/Academic Press. ISBN 978-0-12-374410-4.