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Tracto de polipirimidina

El componente esencial del espliceosoma U2AF se une a un fragmento corto de ARN de polipirimidina.

El tracto de polipirimidina es una región del ARN premensajero (ARNm) que promueve el ensamblaje del espliceosoma , el complejo proteico especializado en realizar el empalme del ARN durante el proceso de modificación postranscripcional . La región es rica en nucleótidos de pirimidina , especialmente uracilo , y suele tener entre 15 y 20 pares de bases de largo y está ubicada entre 5 y 40 pares de bases antes del extremo 3' del intrón que se va a empalmar. [1]

Varios factores proteicos se unen o se asocian con el tracto de polipirimidina, incluido el componente de empalme U2AF y la proteína de unión al tracto de polipirimidina (PTB), que desempeña un papel regulador en el empalme alternativo . La función principal de PTB es el silenciamiento de exones , mediante el cual una región de exón particular normalmente empalmada en el ARNm maduro queda fuera, lo que da como resultado la expresión de una isoforma de la proteína que codifica el ARNm . Debido a que PTB se expresa de manera ubicua en muchos eucariotas superiores , se cree que suprime la inclusión de exones "débiles" con sitios de empalme mal definidos . [2] Sin embargo, la unión de PTB no es suficiente para suprimir exones "robustos". [3]

La supresión o selección de exones es fundamental para la expresión adecuada de isoformas específicas de tejido . Por ejemplo, el músculo liso y el músculo esquelético expresan isoformas alternativas que se distinguen por una selección de exones mutuamente excluyente en la alfatropomiosina . [4]

Referencias

  1. ^ Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Darnell J. (2004). Biología celular molecular. WH Freeman: Nueva York, Nueva York. 5ª edición.
  2. ^ Wagner EJ, García-Blanco MA. (2001). La proteína de unión al tracto de polipirimidina antagoniza la definición del exón. Mol Cell Biol 21(10):3281-3288.
  3. ^ Gooding C, Roberts GC, Smith CW. (1998). Papel de un elemento inhibidor de pirimidina y una proteína de unión al tracto de polipirimidina en la represión de un exón de alfa-tropomiosina regulado. ARN 4:85-100.
  4. ^ Gooding C, Roberts GC, Moreau G, Nadal-Ginard B, Smith CW. (1994). Cambio específico del músculo liso de la selección de exón mutuamente excluyente de alfa-tropomiosina mediante la inhibición específica del exón predeterminado fuerte. EMBO J 13(16):3861-72.