La temporada 2008-09 de la Football Conference fue la quinta temporada en la que la Conferencia estuvo compuesta por tres divisiones, y la trigésima temporada en total. La Conferencia cubre los dos niveles superiores del fútbol no profesional en Inglaterra. La Conference Premier fue el quinto nivel más alto de la pirámide general , mientras que la Conference North y la Conference South existían en el sexto nivel. El mejor equipo y el ganador del playoff de la división Nacional fueron promovidos a la Football League Two , mientras que los últimos cuatro fueron relegados a las divisiones Norte o Sur. Los campeones de las divisiones Norte y Sur fueron promovidos a la división Nacional, junto con los ganadores del playoff de cada división. Los tres últimos en cada una de las divisiones Norte y Sur fueron relegados a las divisiones principales de la Northern Premier League , Isthmian League o Southern League . Por razones de patrocinio, la Conference Premier fue frecuentemente referida como Blue Square Premier.
Un total de 24 equipos disputaron la división, incluidos 18 equipos de la temporada pasada , dos relegados de la Football League Two , dos ascendidos de la Conference North y dos ascendidos de la Conference South.
Equipos ascendidos de la Conferencia Norte 2007-2008
Equipos ascendidos de la Conferencia Sur 2007-2008
Equipos descendidos de la Liga Dos 2007-08
Eastbourne, Mansfield, Lewes y Wrexham aparecen en la Conference Premier por primera vez, mientras que Barrow regresa a la liga después de diez años. Kettering ha sido tres veces subcampeón en esta categoría y regresa a la liga después de una ausencia de cinco años. Altrincham permanece en la Conference después de una tercera prórroga consecutiva del descenso, después del descenso de Halifax Town por razones financieras.
El descenso de Woking puso fin a la permanencia del club más antiguo en la Football Conference, completando diecisiete temporadas en la máxima categoría.
Cambridge United ganó 4-3 en el global.
El Torquay United ganó 2-1 en el global.
Un total de 22 equipos disputaron la división, incluidos 16 equipos de la temporada pasada , tres relegados de la Conferencia Premier , dos ascendidos de la Northern Premier League y uno ascendido de la Southern Football League.
Equipos ascendidos de la temporada 2007-2008 a la División Premier de la Liga Premier del Norte
Equipos ascendidos de la División Premier de la Liga Sur 2007-2008
Equipos descendidos de la Conferencia Premier 2007-08
Droylsden y Farsley regresan tras haber pasado solo una temporada en la liga superior. Fleetwood alcanzó un nuevo récord de once temporadas después de ser reformado tras la quiebra del Fleetwood Town original. Tanto Boston United como Nuneaton Borough fueron expulsados de la liga por razones financieras antes de la temporada, lo que provocó el descenso de Vauxhall Motors y la cancelación del traspaso de Redditch United a la Conference South.
Gateshead ganó 2-1 en el global.
El AFC Telford United ganó 5-4 en el global.
Un total de 22 equipos disputaron la división, incluidos 18 equipos de la temporada pasada , uno transferido de la Conferencia Norte, dos ascendidos de la Liga Istmiana y uno ascendido de la Liga de Fútbol del Sur.
Equipos ascendidos de la División Premier de la Liga Sur 2007-2008
Equipos ascendidos de la Isthmian League Premier Division 2007-08
Equipos transferidos de la Conferencia Norte 2007-08
Ningún equipo descendió a la Conference South desde la Conference Premier, por lo que el Worcester City fue transferido desde la Conference North. La expulsión de dos equipos de la Conference North por razones financieras canceló la transferencia del Redditch United entre los dos equipos y permitió que el Dorchester Town permaneciera en la Conference South. Los cuatro nuevos equipos nunca habían jugado en la Conference South antes.
Hampton & Richmond Borough ganó 3-1 en el global.
Hayes & Yeading United ganó 6-4 en el global.