cromodominio

Un cromodominio ( modificador de la organización de la cromatina ^[2] ) es un dominio estructural proteico de aproximadamente 40 a 50 residuos de aminoácidos que se encuentran comúnmente en proteínas asociadas con la remodelación y manipulación de la cromatina . El dominio está altamente conservado tanto entre plantas como entre animales, y está representado en una gran cantidad de proteínas diferentes en muchos genomas , como el del ratón . Algunos genes que contienen cromodominio tienen múltiples isoformas de empalme alternativas que omiten el cromodominio por completo. ^[3] En los mamíferos , las proteínas que contienen cromodominios son responsables de aspectos de la regulación genética relacionados con la remodelación de la cromatina y la formación de regiones de heterocromatina . ^[4] Las proteínas que contienen cromodominios también se unen a histonas metiladas ^{[5] [6]} y aparecen en el complejo de silenciamiento transcripcional inducido por ARN . ^[7] En las modificaciones de histonas, los cromodominios están muy conservados. Funcionan identificando y uniéndose a residuos de lisina metilados que existen en la superficie de las proteínas de la cromatina y, por lo tanto, regulan la transcripción genética. ^[8]

Ver también

• Bromodominio
• Dominio de sombra cromo

Referencias

1. Min J, Zhang Y, Xu RM (agosto de 2003). "Base estructural para la unión específica del cromodominio Polycomb a la histona H3 metilada en Lys 27". Desarrollo de genes . 17 (15): 1823–8. doi :10.1101/gad.269603. PMC  196225 . PMID  12897052.
2. Messmer S, Franke A, Paro R (julio de 1992). "Análisis del papel funcional del dominio cromo Polycomb en Drosophila melanogaster". Desarrollo de genes . 6 (7): 1241-1254. doi : 10.1101/gad.6.7.1241 . PMID  1628830.
3. Tajul-Arifin K, Teasdale R, Ravasi T, Hume DA, Mattick JS (2003). "Identificación y análisis de proteínas que contienen cromodominio codificadas en el transcriptoma del ratón". Res del genoma . 13 (6B): 1416-1429. doi :10.1101/gr.1015703. PMC 403676 . PMID  12819141. 
4. Jones DO, Cowell IG, Singh PB (2000). "Proteínas de cromodominio de mamíferos: su papel en la organización y expresión del genoma". Bioensayos . 22 (2): 124–37. CiteSeerX 10.1.1.575.6410 . doi :10.1002/(SICI)1521-1878(200002)22:2<124::AID-BIES4>3.0.CO;2-E. PMID  10655032. 
5. Nielsen PR, Nietlispach D, Mott HR, Callaghan J, Bannister A, Kouzarides T, Murzin AG, Murzina NV, Laue ED (2002). "Estructura del cromodominio HP1 unido a la histona H3 metilada en lisina 9". Naturaleza . 416 (6876): 103–7. doi : 10.1038/naturaleza722. PMID  11882902. S2CID  4423019.
6. Jacobs SA, Khorasanizadeh S (2002). "Estructura del cromodominio HP1 unido a una cola de histona H3 lisina 9-metilada". Ciencia . 295 (5562): 2080–3. doi : 10.1126/ciencia.1069473. PMID  11859155. S2CID  38589662.
7. Verdel A, Jia S, Gerber S, Sugiyama T, Gygi S, Grewal SI, Moazed D (2004). "Dirección de heterocromatina mediada por ARNi por el complejo RITS". Ciencia . 303 (5658): 672–6. doi : 10.1126/ciencia.1093686. PMC 3244756 . PMID  14704433. 
8. Yap KL, Zhou MM (marzo de 2011). "Estructura y mecanismos de reconocimiento de la metilación de lisina por el cromodominio en la transcripción de genes". Bioquímica . 50 (12): 1966–80. doi :10.1021/bi101885m. PMC 3062707 . PMID  21288002. 

enlaces externos

• Remodelación de cromatina: cromodominios en cellsignal.com